计算化学公社

标题: 无需root授权 自主安装MPI并行版cp2k v8.2.0 [打印本页]

作者
Author:
abin    时间: 2021-8-2 21:48
标题: 无需root授权 自主安装MPI并行版cp2k v8.2.0
无需自主编译任何东西.

视频教程如下:

CP2K v8.2.0 MPI并行版安装无需root授权 ---> B站视频编号 BV1244y117pG

前序视频是:
无需root授权、自主安装conda ---> B站视频编号BV1Xf4y1G7vQ

以上演示方案, 无系统依赖, 无需root权限.
只要是Linux系统, 能访问网络, 均可以安装.

唯一的难点是, 使用vi打开~/.bashrc, 添加一行内容, 并保存.

原来想的是采用 echo "export XXX YYYY" >> ~/.bashrc 我担心, 年轻人会敲错 >> 或者引号, 那就更麻烦了.

如果特别关注计算效率,
对于intel平台, 推荐采用intel工具链, 本地源码编译所有组件.


作者
Author:
learnerNONE    时间: 2021-9-11 21:03
abin老师,我用您的方法安装了cp2k8.2并试运行了一下,但是运行run-test.sh时出现了一个问题:
...
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
...

(记录自cp2k.err)
我又试了一下直接运行,结果也失败了:
(cp2k-v8.2) [yliu@Surge test82]$ mpirun -np 4 cp2k.psmp -i CH3-BP-MO_DIAG.inp > out
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
[proxy:0:0@Surge] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:591): execvp error on file cp2k.psmp (No such file or directory)
请问这个该怎么处理呢
作者
Author:
abin    时间: 2021-9-11 22:36
新建一个用户ID,
100% follow视频教程搞一遍!

如果你的机器上有任何全局性的环境设定,
请先屏蔽,或者让那个管理员跪地谢罪。

如果你没有100% follow视频操作,
得不到结果是肯定的。

另,我用的算例,就是官方源码中的测试算例之一。






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