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标题: QE 6.8安装记录 [打印本页]

作者
Author: funok 时间: 2021-8-3 18:03
标题: QE 6.8安装记录
本帖最后由 funok 于 2021-8-9 19:44 编辑

安装QE 6.8 并使用pslibrary 1.0.0 生成相应的赝势文件

系统：centos linux release 7.6.1810
预装软件：Intel parallel studio xe 2015(软件安装路径：/opt/intel2015)(intel 2019也可以使用)

下载地址：
QE6.8 :https://github.com/QEF/q-e/releases
pslibrary 1.0.0: https://github.com/dalcorso/pslibrary

(1) 安装QE6.8:
source /opt/intel2015/bin/compilervars.sh intel64
source /opt/intel2015/mkl/bin/mklvars.sh intel64
source /opt/intel2015/impi/5.0.3.049/intel64/bin/mpivars.sh

./configure --prefix=/home/qe

make all install

make.inc 文件中的编译选项为：
MPIF90=mpiifort
F90=ifort
CC=icc

注：运行./configure --prefix=/home/qe之后，当显示如下内容代表并行环境配置成功。
Parallel environment detected successfully.\
Configured for compilation of parallel executables.

(2) 使用pslibrary 1.0.0 生成相应的赝势文件:
在pslibrary 1.0.0 文件夹中，修改QE_path文件中的QE的路径为对应QE安装包的路径，而后运行以下命令即可生成相应的赝势文件

./make_all_ps

复制代码

注：使用同样的方法安装qe-6.6，而后使用社长的帖子http://sobereva.com/562中提供的测试例子，可以正常计算，但后续使用pslibrary 1.0.0生成相应的赝势文件无法使用。
赝势文件可以使用./make_all_test进行测试。

参考网址：
https://www.cnblogs.com/HPC-TOP/p/13259676.html
http://sobereva.com/562
https://yyyu200.github.io/DFTboo ... 01/InstallandLinux/
https://github.com/dalcorso/pslibrary

2021.08.08注：使用上述方法安装的QE在跨节点计算时，会报错（可能是我哪里配置的不对）

2021.08.09注：参照上述方法，只声明mkl的环境变量，并使用openmpi-3.1.4,安装qe-6.8时，可以正常安装，并可以使用pslibrary正常生成赝势文件。
make.inc文件的部分内容：

MPIF90       = mpif90
F90          = gfortran
CC          = gcc

BLAS_LIBS    = -lmkl_gf_lp64  -lmkl_sequential -lmkl_core

SCALAPACK_LIBS = -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64

在同一台机器上，运行社长提供的diamond例子时，intelmpi+icc+ifort+intle_mkl编译生成的执行程序略快于使用openmpi+gcc+gfortran+intel_mkl编译生成的pw.x。

作者
Author: 欧拉角 时间: 2021-8-4 09:24
我们年初增加的DORI的部分（http://bbs.keinsci.com/thread-21546-1-1.html）现在也被加入到了QE6.8的版本，欢迎大家讨论。

作者
Author: renzhogn424 时间: 2021-8-4 22:24
这个赝势和在https://www.materialscloud.org/d ... ciency#sssp-license里下载的哪个好些啊？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-8-4 22:50

renzhogn424 发表于 2021-8-4 22:24
这个赝势和在https://www.materialscloud.org/discover/sssp/table/efficiency#sssp-license里下载的哪个好 ...

PSLib的赝势还可以，SSSP的库中一部分用的是PSLib的。不过实际使用最好还是小心测试。

作者
Author: renzhogn424 时间: 2021-8-5 08:15

卡开发发发表于 2021-8-4 22:50
PSLib的赝势还可以，SSSP的库中一部分用的是PSLib的。不过实际使用最好还是小心测试。

是的，好像SSSP是个混合库，虽然测评但还是担心不同体系的赝势一致性的问题。不知道PSLib的一致性是不是更好。也奇怪，赝势既然是文本文件，为啥pslib还要去生成一下，直接下载不是更方便。

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-8-5 09:25

renzhogn424 发表于 2021-8-5 08:15
是的，好像SSSP是个混合库，虽然测评但还是担心不同体系的赝势一致性的问题。不知道PSLib的一致性是不是 ...

一致性方面倒是没什么问题，不过可能会遇到的情况是，如果要使用模守恒和超软赝势混合的情况仍然需要较大的动能截断，这样超软赝势（或PAW）引入补偿电荷来降低波函数部分的动能截断的优势就没了。

形状一致赝势（包括模守恒、超软赝势等）一般都是
1、先通过全电子方法计算；
2、再给定原子的轨道相关的参数如芯半径等，然后通过赝势产生程序进行生成；
3、最后再比较生成的赝势对不同的原子组态的可迁移性。QE的赝势生成相当于1、3两步都完成了，然后提供了2的输入文件给你自己去产生，如果不想自己产生直接去官网的点pseudopotentials标签中PSLib赝势下载就行了。

作者
Author: renzhogn424 时间: 2021-8-5 11:35

卡开发发发表于 2021-8-5 09:25
一致性方面倒是没什么问题，不过可能会遇到的情况是，如果要使用模守恒和超软赝势混合的情况仍然需要较大 ...

了解，学习了！

作者
Author: rabbitkiller 时间: 2021-8-7 14:24
qe6.8的色散修正里开了并行，计算速度提高了不少，但是我们跑下来发现色散修正计算的原子受力有问题。不知道大家伙儿情况如何？

作者
Author: zhoujy 时间: 2022-1-6 18:21
请问楼主，qe6.8版本在GPU上跑的话，其中的epw模块可以安装在节点上并在GPU上跑吗？

作者
Author: snljty 时间: 2022-1-6 20:00

zhoujy 发表于 2022-1-6 18:21
请问楼主，qe6.8版本在GPU上跑的话，其中的epw模块可以安装在节点上并在GPU上跑吗？

http://bbs.keinsci.com/thread-22198-1-1.html

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