计算化学公社

标题: 工作站购置配置求助 [打印本页]

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sai77    时间: 2021-8-5 08:59
标题: 工作站购置配置求助
主要是用高斯做DFT计算,预算三万左右,当然越低越好。
参考了sob老师的购机推荐,然后又咨询了一下做计算的朋友,他认为高斯并行效率不高,建议把CPU核数减少主频增加。

所以修改了下配置:

CPU:2* XEON Platinum 8124M(18核3.0G,睿频3.5G)
散热器:2*捷豹LGA3647散热器
主板:超微X11DAI-N(C621芯片组,集显)
机械硬盘:希捷ST4000NM000A银河企业级4TB SATA
固态硬盘:PM981 1TB
内存:12*三星DDR4-2666 ECC 16GB  
电源:振华LEADEX HG 650W   
机箱:先马黑洞玻璃版
键鼠+显示器

请帮忙看下这样是否合理?谢谢!


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喵星大佬    时间: 2021-8-5 10:49
支持8124M的超微板子应该是改版的DPI-N吧,但是比较贵,不知道DAI-N支持不支持

8124M确实是个牛皮的玩意
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abin    时间: 2021-8-5 10:56
如果仅做DFT计算, 固态硬盘没啥实际意义.

Gaussian并行效率,
可以参考这个测评:
https://computational-chemistry. ... ussian16-benchmark/

一个简单的评测:
Au/CNH过渡金属配合物体系
61 atoms, 350 eletrons

LanL2TZ(f);6-31G(d)
Ground State, freq

均采用36核心. G16B01.
双路Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2696 v3 @ 2.30GHz
8*8GB
36 cores
33min41s

双路Intel(R) Xeon(R) Platinum 8276M CPU @ 2.20GHz
12 x 16 GB
36 cores
27min10s

两个处理器工作频率相近, 均采用36核心计算.
耗时差异如上.

问题是, 这么点耗时差异, 对得起价格上的差异么?

高斯不支持AVX512指令集,
用skx处理器, 没有特别明显的加速效果.

如果预算有限,
3万, 2686v4, 可以买两台了. 注意, 2686v4, 工作起来主频是2.7GHz.

或者不嫌吵的, 买双子星的2U机器, 4颗2686v4, 你会获得4x18个物理核心.
仅供参考.

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sai77    时间: 2021-8-5 14:06
喵星大佬 发表于 2021-8-5 10:49
支持8124M的超微板子应该是改版的DPI-N吧,但是比较贵,不知道DAI-N支持不支持

8124M确实是个牛皮的玩意

我对照天梯,选了一个核心数少频率高的,这么说这套下来比sob老师推荐的那套还贵吗?
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sai77    时间: 2021-8-5 14:12
abin 发表于 2021-8-5 10:56
如果仅做DFT计算, 固态硬盘没啥实际意义.

Gaussian并行效率,

谢谢指点。从数据看感觉铂金跟E5平台差距不大啊,那为啥铂金贵那么多呢?
要这么看那1万5搞个E5平台足够了,省不少钱
作者
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abin    时间: 2021-8-5 14:40
sai77 发表于 2021-8-5 14:12
谢谢指点。从数据看感觉铂金跟E5平台差距不大啊,那为啥铂金贵那么多呢?
要这么看那1万5搞个E5平台足够 ...

当红女星 和 过期女星, 能是同一个出台价吗?
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sobereva    时间: 2021-8-5 22:51
8124M根本没法用超微X11DAI-N
机子核多完全可以同时跑多个任务
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ghost    时间: 2021-8-6 10:05
这个配置研究过,这cpu挺邪门的,只能用永擎或这技嘉的几款主板。
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janstao    时间: 2021-8-17 14:45
8124M可以用超微X11DAI-N的定制版,不过市场基本没有了,现在有的是X11DPI-N定制版。
另外散热器差,压不住8124M,要换成采融或是猫头鹰。
机箱换成追风者的614PC,先马的个上不了EEB的主板。




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