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标题: gromacs的gpu版本安装遇到报错以及与cpu版本的区别？ [打印本页]

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2021-8-7 11:32
标题: gromacs的gpu版本安装遇到报错以及与cpu版本的区别？
问题一：安装gromacs的gpu版本，在执行make 命令后执行make check遇到了图片中的报错。40可以理解，因为自己并没有安装mpi版本的。在执行make install的时候是可以安装成功的，想请教一下在make check中遇到的错误，是否会影响之后自己模拟计算以及如何解决？
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问题二：
我看网上很多说gou版本是有一些限制的，gpu计算的轨迹是没有问题的，我想请教一下gpu版本的限制主要在哪里？之前看gpu版本的貌似不可以使用group，这样的话我想请教下对于mdp的设置有什么要求？能否提供一份mdp作为参考。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-8 01:30
没必要管make check。实在不放心可以找测试过程产生的文件，如果提供了标准参考文件，看看具体差异有多大。

越往后的gmx版本，GPU运行支持的功能越多、限制越小。mdp没必要特殊考虑，常用的设置GPU运行基本都支持。细节可以看手册。

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