计算化学公社

标题: 计算分子荧光和磷光：Dalton程序示例 [打印本页]

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Author: beefly 时间: 2015-12-29 13:15
标题: 计算分子荧光和磷光：Dalton程序示例
本帖最后由 beefly 于 2015-12-29 23:04 编辑

通过一些输入文件作为例子，演示了用Dalton程序计算分子荧光和磷光的各种方法。

修改了pdf中的一些笔误。已更正。

作者
Author: 小范范1989 时间: 2015-12-29 14:52
敢问beefly大神，这是从哪整的？

很有帮助。谢谢大神。

作者
Author: 暖空 时间: 2015-12-29 15:20
好激动~~看到有关dalton的资料感觉像是见到了亲人！谢谢大神~~

作者
Author: superrice 时间: 2015-12-31 09:34
谢谢！！

作者
Author: 14xlliu 时间: 2015-12-31 10:28
谢谢！！如果是算极化率（超极化率）的例子就好了。

作者
Author: benbaby 时间: 2016-1-5 16:32
这个软件哪里可以搞到啊？

作者
Author: 小范范1989 时间: 2016-1-5 17:20

benbaby 发表于 2016-1-5 16:32
这个软件哪里可以搞到啊？

下载下来pdf，里面有网址。

作者
Author: lindlar 时间: 2016-1-24 21:50
谢谢

作者
Author: zsu007 时间: 2016-1-24 22:25
谢谢分享！

作者
Author: 三石草祭 时间: 2016-6-13 08:57
谢谢分享

作者
Author: xxy88888 时间: 2016-6-18 16:12
感谢分享！

作者
Author: therotyonth 时间: 2016-6-21 19:58
谢谢！！

作者
Author: 阳光总在风雨后 时间: 2016-9-4 10:12
谢谢！我也是这样算的但是输出文件没有速率教程中有一个寿命的公式可带入计算但是单位对不上

作者
Author: blueyangliu 时间: 2017-3-10 14:02
文档在前言中说明，“这适用于比较轻的元素体系，但是无法计算重元素体系的光谱精细结构”，这个轻元素具体什么范围呢？

作者
Author: beefly 时间: 2017-3-13 17:18

blueyangliu 发表于 2017-3-10 14:02
文档在前言中说明，“这适用于比较轻的元素体系，但是无法计算重元素体系的光谱精细结构”，这个轻元素具体 ...

相对而言的。一般5d之前的元素，旋轨耦合可以用微扰处理，5d到U附近的元素，二阶旋轨耦合非常强，一般的微扰处理会失效，除非考虑足够多的标量电子激发态。U之后的元素，微扰方法完全不适用，就得用ADF的soc-zora/tddft一类的方法了。

作者
Author: yang_lzu 时间: 2018-5-2 11:43
各位大神，我想请问dalton是怎么安装的？之前在window下用cmake产生了install文件夹，但是后面就不知道怎么弄了

。再后来在linux（ubuntu）里面也弄了，还是没成功。是不是这个不能在window下运行（在它的论坛上找到这么一句话），但是下载的时候又有zip的压缩包啊，求大神指条明路啊。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-5-2 14:40

yang_lzu 发表于 2018-5-2 11:43
各位大神，我想请问dalton是怎么安装的？之前在window下用cmake产生了install文件夹，但是后面就不知道怎么 ...

CentOS 7.2，root，gfortran，机子有MKL

串行版编译：
./setup --prefix=/sob //会安装到/sob/dalton下面。默认用gfortran和gcc
cd build
make install -j
ctest -j //同时测试四个任务，每个任务串行计算

并行版编译：
安装openmpi：./configure --prefix=/sob/openmpi202; make all install （用-j没用，并不会并行编译）
然后把openmpi目录下的bin、lib加入到PATH和LD_LIBRARY_PATH里
./setup --mpi --prefix=/sob
cd build
make install -j （四核的话8分钟编译完毕，36核的话不到一分钟编译完毕）

把此加入到.bashrc：
export PATH=$PATH:/sob/dalton
export DALTON_TMPDIR=/sob2 则之后临时文件都产生在/sob2/DALTON_scratch_root目录下
export DALTON_LAUNCHER="mpirun -np 36 --allow-run-as-root"
export LSDALTON_LAUNCHER="mpirun -np 36 --allow-run-as-root"

重新进入shell之后可以在build目录下运行ctest进行测试，会一次运行一个任务，并行执行。458个任务悉数通过

Windows下在虚拟机中编译同上。
Windows下你用Cygwin用相同方式编译应当也没问题

作者
Author: yang_lzu 时间: 2018-5-2 14:49
好勒，非常感谢社长答贴，我再试试

作者
Author: 研道 时间: 2018-5-2 15:56
真棒

作者
Author: 小桥流水1102 时间: 2018-6-26 22:33
感谢大神，学习一波~

作者
Author: linqiaosong 时间: 2020-2-10 18:05
beefly大佬，我在dalton的论坛上询问了系数3的问题，对方给出的回复如下：

For transitions between non-degenerate states, the general rule for the total transition rate is to average initial states and sum over final states. In the most common picture with a T->S transition, an ensemble average over the triplet states,assuming they are equally populated, shows up as a factor 1/3
http://forum.daltonprogram.org/v ... 65&p=6688#p6688

所以或许这个3并不能称之为程序bug，以及输出结果应当是合理的。

作者
Author: beefly 时间: 2020-2-13 22:47

linqiaosong 发表于 2020-2-10 18:05
beefly大佬，我在dalton的论坛上询问了系数3的问题，对方给出的回复如下：

所以或许这个3并不能称之为程 ...

对于T-S0跃迁，公式4.1的分子d'=3，分母f_tot是三重态三个分支f之和，若假设三个分支的f相同（f_tot = 3f），可以得到T态每个分支的寿命就是T态整体寿命。Dalton作者好像是把f理解为f_tot了。

公式4.1是赫兹堡第一卷给的，做小分子高分辨光谱的人广泛在用，可以跟实验测量值比较。做光化学的人可能对公式理解有误，或者简并态寿命的定义不一样。

作者
Author: gaussion 时间: 2023-4-25 22:35
本帖最后由 gaussion 于 2023-4-25 22:37 编辑

请问对于含过渡族金属Ir/Au/Pt等大原子的分子，如何算跃迁偶极矩，求大佬点播~

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-26 00:18

gaussion 发表于 2023-4-25 15:35
请问对于含过渡族金属Ir/Au/Pt等大原子的分子，如何算跃迁偶极矩，求大佬点播~

用全电子相对论基组，搭配显式相对论方法（至少ZORA，最好X2C），并且考虑旋轨耦合。其他方面和纯有机体系没什么区别

作者
Author: kaige 时间: 2024-6-3 15:53
谢谢分享

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