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标题: 求助gmx pdb2gmx生成的top文件在尾基多出一个原子 [打印本页]

作者
Author: 1971806673 时间: 2021-8-15 22:13
标题: 求助gmx pdb2gmx生成的top文件在尾基多出一个原子
老师，当我在自己写的PVDF.rtp中只保存残基的[ atoms ]和[ bonds ]时，运行gmx pdb2gmx生成的top文件在尾基会多出一个原子，请问老师这是什么问题？PVDF.rtp文件和生成top文件我附件。
在尾基C2上本来只有H21、FOA、FOB三个原子，但是生成的top多出来了一个H2，不知道怎么办？请老师帮忙看一下。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-15 23:31
仔细看pdb2gmx运行过程的屏幕上的提示
并且检查一下hdb、tdb文件里的设置

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