计算化学公社

标题: 关于限制的问题求助 [打印本页]

作者
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sun666    时间: 2021-8-16 20:57
标题: 关于限制的问题求助
本帖最后由 sun666 于 2021-8-16 21:39 编辑

请教老师在gromacs使用[distance_restraints ],函数形式应为下图
;ai   aj    type     index     type'    low   up1   up2     fac(力常数乘的系数)    (low、up1、up2分别为r0 r1 r2)
10   16   1         0             1          0.0    0.3    0.4       1.0





对于这个形式,type与type' 有什么区别呢,  fac项时力场数乘的系数。力场数又是在哪里设置的呢

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-8-16 22:13
(, 下载次数 Times of downloads: 30)

手册里都有明确说明。没特殊情况type、type'都设1。力常数通过mdp里的disre-fc设置





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