计算化学公社

标题: 使用vmd如何求沿轴向不同位置处每个数分子的氢键数量 [打印本页]

作者
Author: zhharu 时间: 2021-8-18 10:50
标题: 使用vmd如何求沿轴向不同位置处每个数分子的氢键数量
您好老师，有几个问题想请教。
我使用了这个网址http://sobereva.com/54中计算氢键的方法计算氢键，但是没有结果输出，请问使用这个脚本时需要先用vmd打开什么文件吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-18 22:27
载入轨迹，把博文里提到的该运行的内容复制到VMD文本窗口里执行就完了（粘贴后如果提示符没出来，按一次回车），结果会直接输出到屏幕上。没输出肯定是操作不对，或者耗时太高正在算着。

作者
Author: zhharu 时间: 2021-8-19 09:18

sobereva 发表于 2021-8-18 22:27
载入轨迹，把博文里提到的该运行的内容复制到VMD文本窗口里执行就完了（粘贴后如果提示符没出来，按一次回 ...

好的，谢谢老师。

作者
Author: zhharu 时间: 2021-8-19 09:35

sobereva 发表于 2021-8-18 22:27
载入轨迹，把博文里提到的该运行的内容复制到VMD文本窗口里执行就完了（粘贴后如果提示符没出来，按一次回 ...

老师，请问我输进去之后出现expected floating-point number but got "no result"没有得到结果是为什么？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-19 10:03

zhharu 发表于 2021-8-19 09:35
老师，请问我输进去之后出现expected floating-point number but got "no result"没有得到结果是为什么？

远程说不清楚，学点tcl语法（如http://bbs.keinsci.com/thread-157-1-1.html），搞清楚脚本原理仔细调试
不排除是输入文件有问题导致不适合直接用这个脚本

作者
Author: zhharu 时间: 2021-8-20 11:29

sobereva 发表于 2021-8-19 10:03
远程说不清楚，学点tcl语法（如http://bbs.keinsci.com/thread-157-1-1.html），搞清楚脚本原理仔细调试
...

老师，您好，现在脚本可以运行，但是输出结果一直为0

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-21 13:36

zhharu 发表于 2021-8-20 11:29
老师，您好，现在脚本可以运行，但是输出结果一直为0

先看懂脚本的原理，看看当前的脚本是否适合你当前的体系
必要时候，在脚本里插入 puts [变量名] 把中间变量输出到屏幕上便于调试

作者
Author: chen0201 时间: 2023-9-15 20:34

zhharu 发表于 2021-8-20 11:29
老师，您好，现在脚本可以运行，但是输出结果一直为0

请问楼主，我也是报同样的错，expected floating-point number but got "no result"，请问你是怎么操作使得没有报错的呢？

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