计算化学公社

标题: 绘制静电势图时色彩刻度轴的范围如何确定？ [打印本页]

作者
Author: 星斗如盘 时间: 2021-8-19 19:04
标题: 绘制静电势图时色彩刻度轴的范围如何确定？
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)
在绘制分子表面静电势一文中，有下面一段话：
给图上加上色彩刻度轴。选Extensions-Visualization-Color Scale Bar，Color bar width设为0.08，Display title选on并且将Color bar title里写上ESP (kcal/mol)，Minimum和Maximum scale value分别填-22和22，Number of axis labels输入10，Color labels选Black，Label format选Decimal。然后点Draw Color Scale Bar按钮，色彩刻度就出现在画面中了，并且VMD Main窗口中多出了一个名为Color Scale Bar的一项。然后调整它的大小和位置，即双击VMD Main窗口中Color Scale Bar那一项当中的F标签使之变为红色（即不让色彩刻度轴在画面中的位置冻结），而双击其它项目的F标签使它们的F变为黑色（让它们的位置冻结住）。
请问这个范围是根据什么确定的？
Minimum和Maximum scale value分别填-22和22

因为更改这个范围，静电势图的颜色并不会改变？这个范围可以自定义吗？更改后，图的颜色会跟着改变吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-20 07:23
Color Scale Bar插件里上下限是你自己手动设的，只影响刻度轴的显示，不影响分子上的着色效果（实际着色由graphics - representation - trajectory里面设的上下限决定）。通常Color Scale Bar里的上下限应当和graphics - representation - trajectory里设的上下限应一致，这样色彩刻度条的颜色变化才对应实际着色用的颜色变化

作者
Author: 星斗如盘 时间: 2021-8-20 09:37

sobereva 发表于 2021-8-20 07:23
Color Scale Bar插件里上下限是你自己手动设的，只影响刻度轴的显示，不影响分子上的着色效果（实际着色由g ...

谢谢

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