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标题: MM 调用GROMACS力场报错 [打印本页]

作者
Author:
zifei    时间: 2021-8-19 21:04
标题: MM 调用GROMACS力场报错
我用acpype生成的GROMACS和AMBER的力场,用CP2K调用。AMBER的可以正常运行,GROMACS会报“ Caught signal 11 (Segmentation fault: address not mapped to object at address 0x1)”的错误,请问是什么原因呢?体系很简单,就是一个水分子测试的。CP2K的输入文件和GROMACS拓扑文件在附件中。
&GLOBAL
   PROJECT test
   PRINT_LEVEL LOW
   RUN_TYPE ENERGY
&END GLOBAL

&FORCE_EVAL
  METHOD FIST
  &MM
    &FORCEFIELD
        PARMTYPE G96
        PARM_FILE_NAME h2o_GMX.top
        &SPLINE
           EMAX_SPLINE 100000
           RCUT_NB 10.0
        &END
    &END FORCEFIELD

    &POISSON              ! solver for non periodic calculations
      &EWALD
        EWALD_TYPE NONE
      &END EWALD
    &END POISSON
  &END MM

  &SUBSYS                 ! system description
    &CELL
     ABC  20. 20. 20.
    &END CELL
    &TOPOLOGY
        CONN_FILE_FORMAT G96
        CONN_FILE_NAME h2o_GMX.top
        COORD_FILE_FORMAT xyz
        COORD_FILE_NAME h2o.xyz
    &END TOPOLOGY
   &END SUBSYS
&END FORCE_EVAL



作者
Author:
zifei    时间: 2021-8-20 18:26
找到原因了。。G96是gromos的格式,不是gromacs。。。




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