计算化学公社

标题: 关于计算文献中kJ/mol与kcal/mol的选用 [打印本页]

作者
Author: WaterMirror 时间: 2021-8-24 01:36
标题: 关于计算文献中kJ/mol与kcal/mol的选用
本帖最后由 WaterMirror 于 2021-8-24 08:57 编辑

各位老师好！我最近想投一个计算的论文（目标是RSC/Wiley的期刊），我全文选用的能量单位是kJ/mol，感觉kcal/mol的数值太小了，相对值（△△G）分不开。现在很担心审稿人让我全部换掉。因为数据非常多

。请问各位老师这个能量单位审稿人会很较真吗？？？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-8-24 04:38
我觉得这个概率是有的，但是不大。。。圈子里虽然kcal/mol是主流，但是kJ/mol也不是没有。
不过说实话没必要因为“数值太小了，分不开”来选单位，只有两个数的差别小于0.1kcal/mol的时候，kcal/mol才会导致分不开，而DFT的误差比这个大多了，所以分开了也没用，你不能指着一个势垒为10.1kcal/mol的反应说它比另一个势垒为10.0kcal/mol的反应难发生。即使是极其相似的反应，DFT真能算准到0.1kcal/mol，那还有DFT格点误差，格点误差是随机误差，不管多么相似的反应也无法完全误差抵消，而且一般最少也得0.1kcal/mol量级。

作者
Author: WaterMirror 时间: 2021-8-24 09:19

wzkchem5 发表于 2021-8-24 04:38
我觉得这个概率是有的，但是不大。。。圈子里虽然kcal/mol是主流，但是kJ/mol也不是没有。
不过说实话没必 ...

好的，谢谢老师！感觉就看命了。。。也不知道遇到咋样的审稿人。。。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-24 11:36
审稿人只会在你的计算级别的精度上comment，不可能因为用kcal/mol还是kJ/mol去吐槽
但记得投国内的期刊应当都用kJ/mol，因为很多编辑执着于SI单位

作者
Author: WaterMirror 时间: 2021-8-24 18:46

sobereva 发表于 2021-8-24 11:36
审稿人只会在你的计算级别的精度上comment，不可能因为用kcal/mol还是kJ/mol去吐槽
但记得投国内的期刊应 ...

哦哦好的。谢谢卢老师！

作者
Author: xxtnenu 时间: 2025-4-8 23:23

wzkchem5 发表于 2021-8-24 04:38
我觉得这个概率是有的，但是不大。。。圈子里虽然kcal/mol是主流，但是kJ/mol也不是没有。
不过说实话没必 ...

请问老师，1 kcal/mol 这个误差范围算比较大嘛？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-4-9 08:57

xxtnenu 发表于 2025-4-8 23:23
请问老师，1 kcal/mol 这个误差范围算比较大嘛？

不能脱离语境说大不大。
你要是比较一个30kcal/mol的反应和一个20kcal/mol的反应哪个快，那1kcal/mol很小；
你要是算一个手性催化反应，R型产物自由能垒20.0kcal/mol，S型产物自由能垒20.5kcal/mol，那1kcal/mol就很大了，错1kcal/mol连ee值的符号都反了。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-4-9 10:03
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-5-11 23:20 编辑

wzkchem5 发表于 2025-4-9 08:57
不能脱离语境说大不大。
你要是比较一个30kcal/mol的反应和一个20kcal/mol的反应哪个快，那1kcal/mol很 ...

从另一个帖http://bbs.keinsci.com/thread-80-1-1.html的6楼来看，这语境说的是不同位点C-H键解离能。

不过我有点好奇，毕竟都说1 kcal/mol是chemical accuracy的高目标，要达到如此高精度应该得严格控制方法、基组、团簇构型/分子构象、溶剂模型等等所有计算环节的系统误差吧，只要有一个环节误差稍微大点就只能得到inconclusive的结论。一般来说现在有多少这个层次的计算级别可供选择呢？

编辑：这帖也有些讨论

作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2025-4-9 10:18
一般地，美国人喜欢用kcal/mol，欧洲人喜欢用kJ/mol。如果你投的是ACS下面的期刊，就直接用kcal/mol。如果你投的是European Journal of Organic Chemistry，就考虑用kJ/mol吧。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-4-9 10:51

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-4-9 10:03
从另一个帖http://bbs.keinsci.com/thread-80-1-1.html的6楼来看，这语境说的是不同位点C-H键解离能。

...

也得看你是比较两个很相似的反应，还是不那么相似的反应。
如果是手性催化，比R型和S型产物的自由能垒，那么DFT往往就够1kcal/mol精度了。
如果是差别很大的两个反应，即使DLPNO-CCSD(T)也未必够

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