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标题: github中OpenMolcas获取下载文件及安装问题 [打印本页]
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 09:40
标题: github中OpenMolcas获取下载文件及安装问题
本帖最后由 发光 于 2021-8-26 10:44 编辑

各位老师上午好
    (操作均在CentOS7l inux虚拟机中进行)  我在利用 git clone获取OpenMolcas资源时，一开始200多KB，后来下载速度只有几KB,且下载到10%就会失败。(网络用的wifi, 浏览器能正常上网)
    接着在github网站直接下载，发现下载的external文件中lapack等文件均为空文件夹（在cmake ../OpenMolcas，提示缺少lapack；git submodule update --init External/lapack 出现'External/lapack' did not match any file(s) known to git ； yum安装lapack指定到External/lapack，又提示已经安装lapack）。

想请教老师：上述安装问题的原因是什么呢？为什么lapack文件夹是空的？希望老师们解疑，非常感谢！
作者
Author: abin    时间: 2021-8-26 09:58
保证网络正常。
完毕。
作者
Author: 喵星大佬    时间: 2021-8-26 10:11
可能要**上网？
这问题没见过
作者
Author: pwzhou    时间: 2021-8-26 10:11
lapack用系统自带的或者MKL即可
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 10:26
本帖最后由 发光 于 2021-8-26 10:33 编辑
abin 发表于 2021-8-26 09:58
保证网络正常。
完毕。

谢谢您的回复。linux虚拟机本身是能上网的，老师您看是不是由于其他问题？
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 10:33
pwzhou 发表于 2021-8-26 10:11
lapack用系统自带的或者MKL即可

我查了一下，自己系统确实有lapack,但是按照github安装步骤(1)cd OpenMolcas ; (2) git submodule update --init External/lapack
执行（2）开始报错 ，执行了git init 命令后 再执行（2） 出现新报错---External/lapack' did not match any file(s) known to git
所以安装步骤的（2）步要不要执行，还是有替代做法？希望老师解疑
作者
Author: abin    时间: 2021-8-26 10:33
发光 发表于 2021-8-26 10:26
谢谢您的回复。linux虚拟机本身是能上网的

访问github只有几KB/s，还会超时。
你管这叫做网络正常？
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 10:35
喵星大佬 发表于 2021-8-26 10:11
可能要**上网？
这问题没见过

谢谢老师的回复，折腾好多天了。
老师是按照github上的教程安装的OpenMlocas吗
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 10:37
abin 发表于 2021-8-26 10:33
访问github只有几KB/s，还会超时。
你管这叫做网络正常？

好的，谢谢老师
作者
Author: lyj714    时间: 2021-8-26 10:47
本帖最后由 lyj714 于 2021-8-26 10:51 编辑

git clone和你直接下载是有区别的，执行git的一系列操作需要git clone下载的包。如果有lapack，可以跳过git submodule这一步
作者
Author: pwzhou    时间: 2021-8-26 10:47
发光 发表于 2021-8-26 10:35
谢谢老师的回复，折腾好多天了。
老师是按照github上的教程安装的OpenMlocas吗

有好多种安装方法，你可以再看看说明书里面的，用系统自带的lapack或者MKL即可
作者
Author: zjxitcc    时间: 2021-8-26 11:06
安装教程看《量子化学程序OpenMolcas的简易安装》，下载的话，普通用户最好下载Releases里面的最新版，而非master。

LAPACK库最好用MKL的（用它自带的效率会比较低），安装MKL看《Linux下安装Intel oneAPI》；如果不想装2021版，也可以装2019或2020版，可以在论坛上搜parallel studio，有一堆帖子。如果你是在集群上安装，管理员往往都装好了，你只需module load xxx加载相应的库名称即可。
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 13:05
lyj714 发表于 2021-8-26 10:47
git clone和你直接下载是有区别的，执行git的一系列操作需要git clone下载的包。如果有lapack，可以跳过git ...

好的，感谢前辈的回复
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 13:05
pwzhou 发表于 2021-8-26 10:47
有好多种安装方法，你可以再看看说明书里面的，用系统自带的lapack或者MKL即可

好的，万分感谢！
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 13:06
zjxitcc 发表于 2021-8-26 11:06
安装教程看《量子化学程序OpenMolcas的简易安装》，下载的话，普通用户最好下载Releases里面的最新版，而非 ...

感谢老师的回复
作者
Author: beefly    时间: 2021-8-26 13:43
github上的openmolcas是个镜像，而且github在国内的网速很不稳定。建议去gitlab的官网下载，非常快。

如果装了mkl或者linux系统有内置的lapack库，不需要external下面的lapack。如果没有，可以单独下载lapack源代码，解压缩后放到external下面，会自动编译
作者
Author: abin    时间: 2021-8-26 13:48
(, 下载次数 Times of downloads: 26)
如图.

如果出错, 请先保证和图例中一样的编译器套件.
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 14:30
abin 发表于 2021-8-26 13:48
如图.

如果出错, 请先保证和图例中一样的编译器套件.

谢谢老师
作者
Author: 发光    时间: 2021-8-26 14:31
beefly 发表于 2021-8-26 13:43
github上的openmolcas是个镜像，而且github在国内的网速很不稳定。建议去gitlab的官网下载，非常快。

如 ...

十分感谢前辈！
作者
Author: abin    时间: 2021-8-26 14:52
其实吧，gitlab放在GCP上，
也会遭遇不稳定。

如果要稳定的使用git clone这些操作，
可以采用阿里或者腾讯香港。

或者采用其他方式保证网络正常。

能访问百度这种网页，
在理工硕博的工作学习中，不叫做网络正常。
以上，仅仅代表个人观点。



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