计算化学公社
标题:
大体系算普通泛函的单点也需要硬盘速度?
[打印本页]
作者Author:
djjj148
时间:
2021-8-28 22:47
标题:
大体系算普通泛函的单点也需要硬盘速度?
本帖最后由 djjj148 于 2021-8-29 13:47 编辑
一次偶然的机会测试了一下大体系的普通泛函的单点,发现固态硬盘(
P
M
981
)和机械盘(
希捷ST4000NM000A银河企业级
)的计算速度差了20%。这与sob老师之前的测试结果(
硬盘速度与内存容量对量子化学计算速度影响的测试
)不太一样,故和大家分享一下。详细测试如下:191原子的有机体系,单机跑,机器
56核Platinum 8173M,192G内存,计算时都分配170G。其他设置都一样,仅仅通过
GAUSS_SCRDIR把临时文件的目录设置为固态或机械的对应目录。计算过程中产生的临时文件有14G。
# scrf=smd em=gd3bj pbe1pbe tzvp
Generated by pdb2gjf
0 2
复制代码
用时:
P
M
981:
346m7.869s
希捷ST4000NM000A银河企业级:
422m54.513s
或许对于大体系/临时文件较大的任务,即使是普通泛函也对硬盘速度敏感。
作者Author:
sobereva
时间:
2021-8-29 08:51
我不太认为这是硬盘速度导致的差异
也可以对比直接用%rwf把rwf分别指定在两个硬盘上的耗时,也对比一下各个link在两种情况下执行的耗时。也建议多对比几个体系
作者Author:
djjj148
时间:
2021-8-29 19:10
sobereva 发表于 2021-8-29 08:51
我不太认为这是硬盘速度导致的差异
也可以对比直接用%rwf把rwf分别指定在两个硬盘上的耗时,也对比一下 ...
谢谢建议。我等机器空闲了测试一下。
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3