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标题: 求助关于用MS中forcite模块模拟退火过程中热浴的选择 [打印本页]

作者
Author: 小毛驴起飞 时间: 2021-8-29 11:15
标题: 求助关于用MS中forcite模块模拟退火过程中热浴的选择
您好，我想用forcite模块NPT系综模拟退火过程，温度450K-650K，压力在0.005GPa，压浴选择Berendsen，前面结构弛豫过程NVT，NPT选择的是NH热浴，但是看到有帖子说NH不适用变温过程，也看了很多关于热浴选择的内容，想问下这种情况热浴选择哪个比较好呢？以及跑的时长一般是跑几个循环，几ns呢，如何来确定呢？看文献各不一样，所以在此求助各位大大！！！感谢！！！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-29 11:34
我不知道M$里支持哪些，至少Berendsen可以用。如果支持V-rescale用这个

至少跑多少轮周期性退火、跑多长时间，必须结合具体体系才能说

作者
Author: 小毛驴起飞 时间: 2021-8-29 11:50

sobereva 发表于 2021-8-29 11:34
我不知道M$里支持哪些，至少Berendsen可以用。如果支持V-rescale用这个

至少跑多少轮周期性退火、跑多长时 ...

谢谢！！MS中可用的有这些：Berendsen，Andersen，NH,NHL，velocity scale；聚合物体系，原子数为5846，所以想请教一下跑多少轮循环和跑多次时间需要从哪些方面分析呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-8-30 11:25

小毛驴起飞发表于 2021-8-29 11:50
谢谢！！MS中可用的有这些：Berendsen，Andersen，NH,NHL，velocity scale；聚合物体系，原子数为5846， ...

velocity rescale

看你退火想干什么。如果是得到一个当前温度下较合理的结构，一次就可以，原理上退火时间越长越好。你可以看看近10年类似体系模拟的文献里大多用多少时间，到时候审稿人如果问，也可以搬出来文献回复。

作者
Author: 张张包 时间: 2022-5-1 14:23

sobereva 发表于 2021-8-30 11:25
velocity rescale

看你退火想干什么。如果是得到一个当前温度下较合理的结构，一次就可以，原理上退火时 ...

请问老师，在弛豫过程中退火热浴的算法和NVT、NPT的热浴算法，需要保持一致吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-1 16:18

张张包发表于 2022-5-1 14:23
请问老师，在弛豫过程中退火热浴的算法和NVT、NPT的热浴算法，需要保持一致吗？

没特殊理由始终都用velocity rescale，适合各种过程
不强求一致

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