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标题: 求助:gmx grompp报错(dihedrals相关) [打印本页]

作者
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1971806673    时间: 2021-8-30 21:39
标题: 求助:gmx grompp报错(dihedrals相关)
老师您好,我运行 gmx grompp -f em.mdp -c PVDF3.gro -p topol.top -o em.tpr,报错ERROR 1 [file topol.top, line 215]:Proper Dih. multiplicity can not be perturbed 0.837000!=0.000000,应该是我在自己构建rtp的时候[ dihedrals ]构建有问题,我将生成的top文件所有的C-C-C-C组成的二面角注释之后,能量最小化就可以运行了,所以应该是rtp文件[ dihedrals ]部分参数设置有问题,

我将自己构建的rtp文件的[ dihedrals ]部分截屏了,麻烦老师看一下我定义C-C-C-C组成的二面角有问题吗?老师如果发现别的细节错误,还希望老师可以提醒。

作者
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sobereva    时间: 2021-8-31 14:41
注释掉只是逃避问题,而不是解决问题

没完整文件没法说




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