计算化学公社
标题:
求助:gmx grompp报错(dihedrals相关)
[打印本页]
作者Author:
1971806673
时间:
2021-8-30 21:39
标题:
求助:gmx grompp报错(dihedrals相关)
老师您好,我运行 gmx grompp -f em.mdp -c PVDF3.gro -p topol.top -o em.tpr,报错ERROR 1 [file topol.top, line 215]:Proper Dih. multiplicity can not be perturbed 0.837000!=0.000000,应该是我在自己构建rtp的时候[ dihedrals ]构建有问题,我将生成的top文件所有的C-C-C-C组成的二面角注释之后,能量最小化就可以运行了,所以应该是rtp文件[ dihedrals ]部分参数设置有问题,
我将自己构建的rtp文件的[ dihedrals ]部分截屏了,麻烦老师看一下我定义C-C-C-C组成的二面角有问题吗?老师如果发现别的细节错误,还希望老师可以提醒。
作者Author:
sobereva
时间:
2021-8-31 14:41
注释掉只是逃避问题,而不是解决问题
没完整文件没法说
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3