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标题: 求助:能量最小化问题 [打印本页]

作者
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1971806673    时间: 2021-9-3 10:59
标题: 求助:能量最小化问题
老师您好,我通过自己构建rtp文件运行pdb2gmx生成top,我的体系是PVDF,30360个原子,我进行能量最小化之后,我通过gmx energy提取了势能,但是势能还没有稳定,我将em.mdp文件内容上传了,麻烦老师帮我看一下是哪里出问题了?谢谢老师

作者
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sobereva    时间: 2021-9-3 12:54
没必要管这个,MD能正常跑起来就完了
当前的em又不是为了获得精确极小点结构
作者
Author:
1971806673    时间: 2021-9-3 15:20
sobereva 发表于 2021-9-3 12:54
没必要管这个,MD能正常跑起来就完了
当前的em又不是为了获得精确极小点结构

好的,谢谢老师




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