计算化学公社

标题: B-factor着色color bar极大极小值求助 [打印本页]

作者
Author: landian666 时间: 2021-9-3 19:13
标题: B-factor着色color bar极大极小值求助
我用gmx rmsf 计算轨迹的均方根波动并用-oq 输出pdb文件进行 B-factor的着色，请问color bar的最大值和最小值怎么确定？我看手册里有the RMSF values are converted to B-factor values这么一句，但是不知道具体转换后的极大极小值是什么

作者
Author: snljty 时间: 2021-9-3 20:01
打开pdb看一眼不就好了。

作者
Author: rpestana94 时间: 2021-9-3 21:27
You can take the column and do normalization and you get all the values between 0 to 1 for example, in the case you want more control

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-3 22:05
默认情况下着色的上限和下限和所有原子B因子最大值、最小值是一致的。有必要就改，没必要就用默认

作者
Author: landian666 时间: 2021-9-7 15:41
多谢各位，已解决~~

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