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标题: Molclus 1.9.9.6版发布！ [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-4 04:02
标题: Molclus 1.9.9.6版发布！
免费、灵活、易用的分子构象搜索和团簇构型搜索程序Molclus的1.9.9.6版已于今日发布，现在可以在主页http://www.keinsci.com/research/molclus.html下载

本次更新的内容如下：

• molclus的setting.ini设置文件里现在可以设置热力学量计算程序Shermo（http://sobereva.com/soft/shermo/）的路径和运行参数，当molclus调用Gaussian或ORCA做freq或opt freq任务后会自动调用Shermo来算热力学量，比Gaussian和ORCA自身算热力学数据的代码更灵活、强大、可靠。见《使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索》（http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html）里加入的说明。
• genmer组件的genmer.ini设置文件里现在可以在末尾加入一行$distcons，然后下面通过一行或多行，指定一对或多对元素间必须满足的距离范围（没设的话就不做限制），例如写H Mg 2.0就代表氢和镁之间距离不能小于2.0埃，Pt Pt 1.8 3.2代表铂之间距离必须在1.8~3.2埃。违背约束条件的构型会被视为失败而不输出。genmer.ini末尾还可以加入一行$modrad，然后在下面通过一行或多行，对一个或多个元素半径进行修改，比如Pt 3.5就把半径改为了3.5埃。详见《genmer：生成团簇初始构型的超便捷工具》（http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html）里面新加入的说明和例子。
• genmer组件启动时如果发现当前目录下没有genmer.ini，将会提示用户手动输入配置文件路径，因此不是非得叫genmer.ini且放在当前目录不可了。molclus启动时如果发现当前目录下没有traj.xyz和settings.ini，也会直接让用户手动输入它们的路径。

作者
Author: chemicalchange 时间: 2021-9-4 16:36
老师您好，请问Linux下的molclus中指定Shermo的路径需要像默认示例一样写windows下exe文件的路径吗

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-5 01:21

chemicalchange 发表于 2021-9-4 16:36
老师您好，请问Linux下的molclus中指定Shermo的路径需要像默认示例一样写windows下exe文件的路径吗

Linux版Shermo可执行文件不带后缀

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