计算化学公社

标题: 如何计算多条链之间的氢键数目？ [打印本页]

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2021-9-5 19:53
标题: 如何计算多条链之间的氢键数目？
目的是：有多条链，计算链与链之间的氢键数目。比如，有四条链，分别为a,b,c,d，如果我将abcd命名为12，在计算氢键的时候，选择12，12。计算的是abcd链与链之间的氢键以及abcd每条链内的氢键数目，我想请教一下，如何只计算abcd链与链之间的氢键？

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2021-9-6 10:48
我选择了一条链的氧原子(一个原子，一共十个原子)，还有羟基（两个原子，一共二十个原子），在计算氢键的时候，为什么显示donors为10，acceptors为20？

作者
Author: panernie 时间: 2021-9-6 13:09
做索引组

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-6 17:16
ab,bc,cd,ac...等6种组合的情况都计算，最后加和

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2021-9-7 16:08

sobereva 发表于 2021-9-6 17:16
ab,bc,cd,ac...等6种组合的情况都计算，最后加和

谢谢老师

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2021-9-7 16:09

panernie 发表于 2021-9-6 13:09
做索引组

谢谢

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