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标题: 求助弯曲过程模拟运行md报错 [打印本页]

作者
Author: 1971806673 时间: 2021-9-5 22:16
标题: 求助弯曲过程模拟运行md报错
老师您好，我有两个问题：1、（非弯曲过程模拟）第一个产物模拟过程，在通过em、nvt、npt平衡之后，我在md.mdp文件设置了define = -DPOSRES,使用了posre.itp文件，运行结束之后，能量和体积的变化趋势我做了图，一直在上下波动，麻烦老师看一下这是什么原因造成的？

2、（弯曲过程模拟）第一个产物模拟过程，在通过em、nvt、npt平衡之后，我建立了一个索引文件（索引文件已上传），我运行gmx grompp -f md.mdp -c npt.gro -r npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -n index.ndx -o md.tpr -maxwarn 2生成md.tpr文件，运行 gmx mdrun -v -deffnm md，然后报错（详细错误我以图片形式上传了）
麻烦老师可以帮我看一下，谢谢老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-6 17:21
起码发个体系截图，别人都不知道你模拟的是什么

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