计算化学公社

标题: 请教关于二聚体ICT的荧光重组能和非辐射速率的计算问题 [打印本页]

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Author: wILlD 时间: 2021-9-6 14:40
标题: 请教关于二聚体ICT的荧光重组能和非辐射速率的计算问题
想在高斯计算之后，通过momap计算二聚体ICT的荧光辐射速率、重组能和非辐射速率，分子模型类似下图。但是momap的老师告诉我他们的软件计算发光性质是对应的单分子体系。我想问下这种情况下该如何计算二聚体重组能和非辐射速率呢？
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作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-9-6 16:27
一般而言，量化计算里不区分单分子和若干个分子的非共价复合物，因为共价相互作用和非共价相互作用没有明确界限。如果一个方法能用于单分子，那么它几乎肯定可以用于有限多个分子的复合物，虽然可能未必适用于无限多个分子的复合物（比如完整的分子晶体）。但是即便你要算分子晶体，也可以用有限多个分子来近似。
如果实在不放心，你就问momap的老师，能不能算二聚体。估计他们说只能算单分子的时候想说的是不能算分子晶体整体，没想说超过一个分子就不行了

作者
Author: wILlD 时间: 2021-9-6 16:46

wzkchem5 发表于 2021-9-6 16:27
一般而言，量化计算里不区分单分子和若干个分子的非共价复合物，因为共价相互作用和非共价相互作用没有明确 ...

感谢您的回复，那我等高斯计算结果出来之后，用momap试试看情况如何.

作者
Author: 小范范1989 时间: 2021-9-6 21:06

wILlD 发表于 2021-9-6 16:46
感谢您的回复，那我等高斯计算结果出来之后，用momap试试看情况如何.

你用momap算的话，应该evc出不来，会报错。
研究二聚体发光是实验确认的？二聚体的光谱和单分子的光谱不一样，最好先确定好。

作者
Author: wILlD 时间: 2021-9-6 21:14

小范范1989 发表于 2021-9-6 21:06
你用momap算的话，应该evc出不来，会报错。
研究二聚体发光是实验确认的？二聚体的光谱和单分子的光谱不 ...

是的，实验结果显示很可能是二聚体。请问如果是这样有什么计算方法可以得到非辐射速率嘛？

作者
Author: 小范范1989 时间: 2021-9-6 22:01

wILlD 发表于 2021-9-6 21:14
是的，实验结果显示很可能是二聚体。请问如果是这样有什么计算方法可以得到非辐射速率嘛？

可以根据报错，修改一下momap的里面认定的成键方法，可以看群里有很多的讨论。
这是是用重组能或者是几何结构变化量等来衡量无辐射可以不？我记得有文章这样搞。

作者
Author: wILlD 时间: 2021-9-7 08:25

小范范1989 发表于 2021-9-6 22:01
可以根据报错，修改一下momap的里面认定的成键方法，可以看群里有很多的讨论。
这是是用重组能或者是几 ...

好的，到时候试试。谢谢指点

作者
Author: wILlD 时间: 2021-10-20 10:49

小范范1989 发表于 2021-9-6 22:01
可以根据报错，修改一下momap的里面认定的成键方法，可以看群里有很多的讨论。
这是是用重组能或者是几 ...

您好，高斯算完之后提交给momap确实报错nv is incorrect.让设置 set_cart=t 或者 check_gmatrix_stop=f.可是改了设置之后仍然不行。咨询技术人员说是没有添加计算二聚体的功能。想请问您如何修改momap的判定呢？以及这个群是论坛的群，还是momap的群呢？我询问了一下好像了解这种问题的人不是很多。

作者
Author: wILlD 时间: 2021-10-20 11:05

小范范1989 发表于 2021-9-6 22:01
可以根据报错，修改一下momap的里面认定的成键方法，可以看群里有很多的讨论。
这是是用重组能或者是几 ...

同时也想请教是否有其他方法或者软件可以实现二聚体重组能和非辐射越前速率的计算呢？

作者
Author: 汪文焕 时间: 2023-5-29 14:53

wILlD 发表于 2021-10-20 10:49
您好，高斯算完之后提交给momap确实报错nv is incorrect.让设置 set_cart=t 或者 check_gmatrix_stop=f. ...

您好，请问set_cat=t 这个设置，是基于什么原理呢，或者说这个设置变化的是哪个模块呢，会影响后面Kp,Kisc的计算吗？

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