计算化学公社

标题: 求助,cp2k振动分析的泛函选择问题 [打印本页]

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beaveror    时间: 2021-9-8 08:52
标题: 求助,cp2k振动分析的泛函选择问题
大家好,我在使用cp2k对晶胞进行振动分析时(VIBRATIONAL_ANALYSIS),采用B3LYP 6-311G**产生的out文件在multiwfn上不能绘制出红外谱图,但是采用cp2k默认的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组产生的out文件却可以绘制红外谱图,请问一下这是什么原因。(因为计算单分子采用了B3LYP 6-311G**,想用同样的基组做对比,不过DZVP-MOLOPT-SR-GTH确实很好用,计算速度比前者高很多)
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wzkchem5    时间: 2021-9-8 15:20
你标题和内容问的不是一个问题,“采用cp2k默认的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组”的时候,你用的泛函是哪个?
另外检查B3LYP计算的输出文件有没有正常结束,有没有振动频率、红外强度信息。问问题之前应该先自己尝试分析问题,自己搞不定再来问,别把cp2k的输出文件当成黑箱子,拿Multiwfn读不出来就来问为什么,应该自己打开输出文件看一下
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sobereva    时间: 2021-9-9 01:30
“不能绘制出红外谱图”这种描述没有任何信息量,说清楚怎么不能,并且上传压缩后的输出文件
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beaveror    时间: 2021-9-11 15:01
wzkchem5 发表于 2021-9-8 15:20
你标题和内容问的不是一个问题,“采用cp2k默认的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组”的时候,你用的泛函是哪个?
另 ...

好的,确实应该,我先自己尝试分析一下,受教了
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beaveror    时间: 2021-9-15 10:30
sobereva 发表于 2021-9-9 01:30
“不能绘制出红外谱图”这种描述没有任何信息量,说清楚怎么不能,并且上传压缩后的输出文件

老师好,我又重新做了一遍,不能绘制图谱的具体表现为:输入选项(1:IR)之后闪退,文件中以B3LPY命名的文件可以绘制出纵轴,无数据,GTH-PBE命名的文件闪退。一个晶胞结构中只有一个分子的文件命名为one.out,一个晶胞中有四个分子的命名为four.out,两个文件除了晶胞信息外完全相同,但晶胞中仅有一个分子的可以绘制谱图,有四个分子的则不行(四个文件使用的都是同一个物质)希望老师能指点一下看哪里出现了错误,感谢

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sobereva    时间: 2021-9-16 07:15
beaveror 发表于 2021-9-15 10:30
老师好,我又重新做了一遍,不能绘制图谱的具体表现为:输入选项(1:IR)之后闪退,文件中以B3LPY命名的文 ...

B3LYP那个任务根本没算完,一看输出文件末尾就知道

four.out里有很多数据异常,比如84543行的频率都是星号,Multiwfn没法读取,仔细检查输入文件的合理性
VIB|                       250                  251                  252
VIB|Frequency (cm^-1) ************         ************         ************

GTH-PBE也有很多频率是星号无法读取,77385行
VIB|Frequency (cm^-1) ************         ************         -9745.706894

要么计算设置不合理,要么结构没在当前级别优化过
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做一头安静的猪    时间: 2025-2-23 16:22
本帖最后由 做一头安静的猪 于 2025-2-28 16:24 编辑
sobereva 发表于 2021-9-16 07:15
B3LYP那个任务根本没算完,一看输出文件末尾就知道

four.out里有很多数据异常,比如84543行的频率都是 ...

你好,频率是*号的问题解决了吗?请问是怎么解决的
----------------------------后续----------------------------------
不好意思,发错位置了。
分享一下后续,input中统一一下精度,还有固定无关原子,输出为****的问题就解决了。

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sobereva    时间: 2025-2-23 17:03
做一头安静的猪 发表于 2025-2-23 16:22
你好,频率是*号的问题解决了吗?请问是怎么解决的

回复我的帖子做什么,明明是楼主的问题




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