计算化学公社

标题: 关于cp2k从头算体系平衡判断、密度计算等一些基本问题的请教 [打印本页]

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Charlie-Ma    时间: 2021-9-8 10:35
标题: 关于cp2k从头算体系平衡判断、密度计算等一些基本问题的请教
本帖最后由 Charlie-Ma 于 2021-9-8 11:13 编辑

大家好,最近刚开始学习cp2k,想用cp2k做从头算分子动力学模拟,想请教大家一些基本的问题。

1. 如何判断从头算模拟体系是否达到了平衡,有哪些方法或者输出参数可以参考判断?比如说电子步稳定在5步以内收敛是否可以说体系达到了平衡?

2. 由于很多时候不知道某体系在某一温度下的实际密度?如果建模时的密度高于或低于体系的实际密度,对平衡结构的准确性影响大吗?

3. 从头算的输出参数里哪里可以看到体系的密度,压强,模拟盒子边长等参数呢?lammps中可以通过thermo_style控制输出到log文件中,但是不知道cp2k咋输出?

4. 关于&MGRID中CUTOFF的选取,由于体系中含有O,是不是需要选取大于等于800Ry的值呢?选取这么大的值对计算速度会不会影响很大?

5. cp2k做从头算一般计算多少原子的体系?64核的服务器,考虑到精确性和效率,大概能跑多大体系合适呢?

6. 请问论坛里有没有用从头算做玻璃体系的同学,能否加个好友请教学习一下?

谢谢大家!











作者
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sobereva    时间: 2021-9-9 01:46
1 具体拿什么说事看具体体系
诸如盒子体积或密度、势能、温度等都可以拿来作为判据。不清楚的话就多看点计算文章

2 控压,让盒子尺寸自发调节就完了

3 输出文件里就有盒子信息

4 没法一概而论,跟你用的基组关系很大,而且多大也看做什么计算

5 看具体计算级别,跑多长时间,体系是什么构成。没法简单说。多看些近几年CP2K跑AIMD的文章就大概有感觉了





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