计算化学公社

标题: 该在vmd.rc里添加什么内容才能让VMD里默认画图方法为CPK [打印本页]

作者
Author: slope 时间: 2021-9-10 13:22
标题: 该在vmd.rc里添加什么内容才能让VMD里默认画图方法为CPK
各位老师好，近期在使用VMD画电荷分布图时，有些问题：
1.我想打开VMD能默认以CPK的画图方法（drawing method）打开模型；
2.我想打开VMD时能默认以电荷（charge）的着色方法（coloring method）对模型着色；

我在vmd.rc文件中添加以下内容，发现并不能实现上述目标：
coloring method charge
drawing method cpk

所以想请教下各位，该添加什么内容呢，对这方面不太熟悉，希望能获得指导，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-11 03:00
加上
mol default style CPK
mol default color Charge

作者
Author: slope 时间: 2021-9-11 15:28

sobereva 发表于 2021-9-11 03:00
加上
mol default style CPK
mol default color Charge

谢谢老师，请问这方面有没有什么资料可以学习学习学习呢，之前在网上查阅了一下，但是没有找到相关资料。
谢谢老师！

作者
Author: tjuptz 时间: 2021-9-11 20:00

slope 发表于 2021-9-11 15:28
谢谢老师，请问这方面有没有什么资料可以学习学习学习呢，之前在网上查阅了一下，但是没有找到相关资料。 ...

vmd的手册有详细的介绍

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-12 05:31

slope 发表于 2021-9-11 15:28
谢谢老师，请问这方面有没有什么资料可以学习学习学习呢，之前在网上查阅了一下，但是没有找到相关资料。 ...

VMD user guide里面有所有内置命令的说明，有空过目一遍，有些地方说得可能不很清楚，结合google搜索

作者
Author: gejuqing 时间: 2022-11-2 20:48

sobereva 发表于 2021-9-11 03:00
加上
mol default style CPK
mol default color Charge

sob老师我的VMD版本是1.9.3，但是vmd.rc中加入mol default style CPK并不能在打开pdb文件时默认以CPK方法画图（依旧是以line方法)，这是为什么呢

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-3 08:47

gejuqing 发表于 2022-11-2 20:48
sob老师我的VMD版本是1.9.3，但是vmd.rc中加入mol default style CPK并不能在打开pdb文件时默认以CPK方法 ...

我没有遇到过此问题

启动后把mol default style CPK输入文本窗口运行，再载入文件，看什么情况

作者
Author: gejuqing 时间: 2022-11-3 09:55

sobereva 发表于 2022-11-3 08:47
我没有遇到过此问题

启动后把mol default style CPK输入文本窗口运行，再载入文件，看什么情况

谢谢sob老师，找到问题了，我发现先启动VMD再载入文件，这时就会以VMD方式显示，而直接双击打开的pdb文件会以line方式显示

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