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标题: NAMD力场文件转化GROMACS立场文件求助 [打印本页]

作者
Author: sun666 时间: 2021-9-12 10:34
标题: NAMD力场文件转化GROMACS立场文件求助
在文献中看到了我想模拟的分子的力场文件，不过作者是用的NAMD，给出的力场文件也是NAMD的格式。我没有了解过NAMD，因此读不懂力场文件信息。不知该如何进行转化，请各位帮忙，感谢感谢。文献力场信息的附件已上传。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-12 20:48
用ParmED可以转换
但在此之前至少应该了解一下NAMD的psf文件、参数文件是什么东西、什么形式，要不然SI里的内容你也看不懂

作者
Author: lyy043 时间: 2023-5-16 11:40

sobereva 发表于 2021-9-12 20:48
用ParmED可以转换
但在此之前至少应该了解一下NAMD的psf文件、参数文件是什么东西、什么形式，要不然SI里 ...

老师，ParmED可以将CHARMM的力场转换成NAMD的吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-16 20:48

lyy043 发表于 2023-5-16 11:40
老师，ParmED可以将CHARMM的力场转换成NAMD的吗？

我不用CHARMM和NAMD，但据我印象中这俩程序的力场参数文件形式是一样的，不需要转换

作者
Author: lyy043 时间: 2023-5-17 08:21

sobereva 发表于 2023-5-16 20:48
我不用CHARMM和NAMD，但据我印象中这俩程序的力场参数文件形式是一样的，不需要转换

嗯嗯，谢谢老师的解答

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