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标题: 求助含有n个相同单元的gromacs的gro文件的建立 [打印本页]

作者
Author: Jerryluo 时间: 2021-9-13 00:25
标题: 求助含有n个相同单元的gromacs的gro文件的建立
大家好，我想建立类似如图的top文件，考虑到有n个相同的单元(图中红框部分)。用acpype.py脚本生成1个单元的top文件，
则主top文件中[molecules] 为n mol该单元。但是用gview保存出来的整体n个单元的 mol2 文件用VMD转成gro文件时，该整体文件里每个单元的原子
顺序对不上，比如第一个单元原子依次是是OPOC...，第二个单元的就便成了OPCC...,请问整种情况应该怎样处理。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-13 04:44
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