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标题: gromacs的计算电生理学功能（CompEL）请教 [打印本页]

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Author: 芝士栗子小甜饼 时间: 2021-9-14 14:45
标题: gromacs的计算电生理学功能（CompEL）请教
各位老师好，我构建的体系是五个Pt层和Pt层之上的一些溶剂分子和我的聚电解质分子，我现在想要达到的目的是，当我的溶剂分子运动到Pt层附近时（假设质心之间相差0.5nm），这个溶剂分子就消失（模拟溶剂分子接触到Pt层之后就反应了），然后溶剂分子再从盒子另一端出现。想询问的问题是这样的目的可以通过ComEL功能实现吗？看了一下手册中的关于计算电生理学的解析感觉对于怎样写mdp有一些困惑。

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