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标题: 如何给金属板加一个不随时间变化的速度，且保持恒温？ [打印本页]

作者
Author: Wenchuan 时间: 2021-9-15 21:35
标题: 如何给金属板加一个不随时间变化的速度，且保持恒温？
在用GROMACS时，含有金属板的体系平衡模拟完成后，要进行正式模拟，在模拟过程中需要给金属板加入整体初速度，且此整体速度保持不变，又需要此金属板恒温，这时候如果通过修改结构文件加入初速度，再在mdp文件中设置恒温，金属板的整体速度在模拟过程中会变化，那么要达到上述要求应该怎么设置呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-16 08:53
能直接实现的做法也就是用constraint方式的pull了

作者
Author: Wenchuan 时间: 2021-11-17 17:18

sobereva 发表于 2021-9-16 08:53
能直接实现的做法也就是用constraint方式的pull了

多谢您的解答，对于您的方法，我想知道constraint方式的pull能使金属板不停地在一个方向上周期性运动吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-18 05:16

Wenchuan 发表于 2021-11-17 17:18
多谢您的解答，对于您的方法，我想知道constraint方式的pull能使金属板不停地在一个方向上周期性运动吗？

忘了，可以找个简单体系试试，也许可以

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