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标题: 关于键临界点BCP计算氢键键能 [打印本页]

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zhb    时间: 2021-9-20 20:10
标题: 关于键临界点BCP计算氢键键能
老师,您好,根据文章计算分子内氢键键能的几种方法http://sobereva.com/522http://bbs.keinsci.com/thread-15496-1-1.html),这种方法仅限气相中计算氢键键能吗?可不可用在溶剂中分子计算?不能的话,如果计算溶剂中分子间氢键应该怎么计算呢?比如一个分子在甲醇溶剂中与一个甲醇分子之间形成氢键,我该怎么算它俩之间氢键的结合能呢?谢谢老师了


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wzkchem5    时间: 2021-9-20 23:03
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-9-20 16:05 编辑

除了BCP以外的那些方法都可以在溶剂里用。BCP法我觉得应该不能算溶剂里的绝对氢键强度(除非有文献专门对溶剂里的氢键强度重新拟合了线性关系,你可以查一下有没有),但是比较同类氢键的相对强度还是可靠的。此外注意,用隐式溶剂模型时,只有结合自由能的结果比较靠谱,结合能/结合焓算不准,因为溶剂化自由能一般没办法拆成焓和熵的贡献

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sobereva    时间: 2021-9-21 06:02
BCP拟合的那个式子没法直接用于算溶剂中的。溶剂下的氢键键能还得考虑溶解自由能。
算溶液下的直接整体电子能量减去俩片段电子能量就完了,电子能量在隐式溶剂模型下计算

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Sunyuting    时间: 2023-3-10 08:42
sobereva 发表于 2021-9-21 06:02
BCP拟合的那个式子没法直接用于算溶剂中的。溶剂下的氢键键能还得考虑溶解自由能。
算溶液下的直接整体电 ...

那我想请教一下,如果想算溶剂中的分子内氢键,该选哪种方式进行计算呢?主要想比较手性对映异构体间的分子内氢键差异,只需要一个相对比较的结果即可。谢谢老师
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sobereva    时间: 2023-3-11 23:18
Sunyuting 发表于 2023-3-10 08:42
那我想请教一下,如果想算溶剂中的分子内氢键,该选哪种方式进行计算呢?主要想比较手性对映异构体间的分 ...

严格计算参考下文
计算分子内氢键键能的几种方法
http://sobereva.com/522http://bbs.keinsci.com/thread-15496-1-1.html

对于只是大致对比相对大小,照常按下文基于BCP性质算就可以
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html
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Sunyuting    时间: 2023-3-13 13:41
sobereva 发表于 2023-3-11 23:18
严格计算参考下文
计算分子内氢键键能的几种方法
http://sobereva.com/522(http://bbs.keinsci.com/th ...

受教了,谢谢老师




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