计算化学公社

标题: 求助,使用gromacs的x2top创建力场时出现问题 [打印本页]

作者
Author:
zll    时间: 2021-9-22 15:06
标题: 求助,使用gromacs的x2top创建力场时出现问题

出现的问题
(, 下载次数 Times of downloads: 22)

n2t文件
(, 下载次数 Times of downloads: 17)
请问各位老师,应该怎么修改呢

作者
Author:
Lacrimosa    时间: 2021-9-22 16:03
看报错信息应该是H-O的距离不太合适,你可以先量一下再相应修改一下n2t文件中H-O的距离
作者
Author:
zll    时间: 2021-9-22 16:09
Lacrimosa 发表于 2021-9-22 16:03
看报错信息应该是H-O的距离不太合适,你可以先量一下再相应修改一下n2t文件中H-O的距离

已经修改好多次O-H的距离了,还是不对
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-9-23 06:32
信息不充分,体系结构图或结构文件都没有,没法判断n2t是否合理
直接导致这种提示的原因就是n2t文件定义得不合理,只能反复检查。

另外,不排除个别版本有bug的可能。如果绝对确信n2t与结构文件对应没问题,别用这么老版本,用新版本再试

作者
Author:
zll    时间: 2021-9-23 10:33
sobereva 发表于 2021-9-23 06:32
信息不充分,体系结构图或结构文件都没有,没法判断n2t是否合理
直接导致这种提示的原因就是n2t文件定义得 ...

好的,谢谢。我再试试




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