计算化学公社

标题: 请问如何从cif文件中提取出团簇模型 [打印本页]

作者
Author:
流年2022    时间: 2021-9-24 10:17
标题: 请问如何从cif文件中提取出团簇模型
cif信息如下#*********************************************************************************## Crystallographic Information File for NaZ-21 ## Reference : #   Shepelev, Yu.F., Smolin, Yu.I., Butikova, I.K. and Tarasov, V.I.#   Dokl. Akad. Nauk SSSR, 272, 1133-1137, (1983)### CIF downloaded from the IZA-SC Database of Zeolite Structures# Ch. Baerlocher and L.B. McCusker,# Database of Zeolite Structures: http://www.iza-structure.org/databases/ ##**********************************************************************************data_NaZ-21_chemical_name_systematic 'NaZ-21'_cell_length_a      36.95_cell_length_b      36.95_cell_length_c      36.95 _cell_angle_alpha   90 _cell_angle_beta    90 _cell_angle_gamma   90_cell_formula_units_Z   1_space_group.name_H-M_ref   'F d -3'_symmetry_space_group_name_H-M   'F d -3'_symmetry_space_group_name_Hall  '-F 2uv 2vw 3'_space_group.IT_number  203 _space_group.IT_coordinate_system_code  '2'  loop__atom_site_label_atom_site_type_symbol_atom_site_fract_x_atom_site_fract_y_atom_site_fract_z_atom_site_B_iso_or_equiv_atom_site_occupancyNA1  Na  0.042  0.042  0.042  3  1NA2  Na  0.2312  0.2132  0.2132  0.8  0.56NA3  Na  0.2337  0.2337  0.2337  3  0.26NA4  Na  0.6964  0.6964  0.6964  2.4  0.77NA5  Na  0.4184  0.4184  0.4184  3  0.53NA6  Na  0.4322  0.4322  0.4322  3.5  0.21NA7  Na  0.4564  0.4564  0.4564  3.3  0.09NA8  Na  0.177  0.0742  0.8278  2.1  0.46NA9  Na  0.1895  0.0621  0.8156  2.4  0.24NA10  Na  0.2006  0.0501  0.7983  2.6  0.23NA11  Na  0.1805  0.0705  0.4323  2.7  1NA12  Na  0.2723  0.1111  0.3621  2.8  0.6NA13  Na  0.2541  0.111  0.3615  0.9  0.25NA14  Na  0.2311  0.1084  0.364  3  0.15SI1  Si  0.2481  0.0633  0.6252  0.4  1SI2  Si  0.3103  0.1213  0.7456  0.5  1SI3  Si  0.1717  0.0154  0.954  0.4  1SI4  Si  0.223  0.0852  0.2858  0.7  1AL1  Al  0.3141  -0.0016  0.8749  0.5  1AL2  Al  0.2484  0.1221  0.8066  0.5  1AL3  Al  0.2965  0.0164  0.0794  0.4  1AL4  Al  0.285  0.0853  0.2273  0.7  1O1  O  0.2151  0.0365  0.6145  1.6  1O2  O  0.1613  0.0917  0.7357  1  1O3  O  0.3857  0.0308  0.036  1.7  1O4  O  0.258  0.0866  0.5894  1.3  1O5  O  0.1135  0.0417  0.4616  1.4  1O6  O  0.1982  0.0495  0.9583  1.6  1O7  O  0.3626  0.0346  0.7917  1.4  1O8  O  0.3261  0.0877  0.506  1.8  1O9  O  0.2529  0.0944  0.8444  1.4  1O10  O  0.3209  0.0698  0.2537  1.9  1O11  O  0.216  0.1228  0.9583  1.7  1O12  O  0.2652  0.0686  0.9861  1.8  1O13  O  0.2454  0.1656  0.8233  1.9  1O14  O  0.1723  0.0018  0.2433  2  1O15  O  0.2803  0.0436  0.3807  1.7  1O16  O  0.2839  0.0653  0.1852  1.8  1H2O1  O2-(H2O)  0.2685  0.2685  0.2685  7.3  0.89H2O2  O2-(H2O)  0.3699  0.0673  0.1659  2.6  0.17H2O3  O2-(H2O)  0.3693  0.0758  0.1748  3.8  0.63H2O4  O2-(H2O)  0.3679  0.0911  0.1828  2.3  0.2H2O5  O2-(H2O)  0.0754  0.0754  0.0754  6.3  0.4H2O6  O2-(H2O)  0.3268  0.125  0.625  5.5  0.86H2O7  O2-(H2O)  0.1558  0.0849  0.888  5.4  0.6H2O8  O2-(H2O)  0.1471  0.1066  0.8896  4.6  0.36H2O9  O2-(H2O)  0.3553  0.0276  0.3912  6.3  0.38H2O10  O2-(H2O)  0.3496  0.0471  0.3987  3.4  0.61H2O11  O2-(H2O)  0.2063  0.0449  0.1043  3.8  0.29# End of data for NaZ-21                               


作者
Author:
wangy0822    时间: 2021-9-24 11:33
Sob老师在Bilibili的视频教程

《基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构》(https://www.bilibili.com/video/av35864488/
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-9-24 11:33
发帖时候把格式整理好,文字密密麻麻堆在一起叫怎么回事

标题和帖子内容是独立的,重要信息不要光写在标题里

基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构
https://www.bilibili.com/video/av35864488/





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3