计算化学公社

标题: QE版本选择和多核调用 [打印本页]

作者
Author: ZZG 时间: 2021-9-27 18:38
标题: QE版本选择和多核调用
请问大佬，
我在终端或者组里的Xshell服务器里用sudo apt-get install 命令下载QE(目前是6.4.1)和下载最新版本6.8有什么区别，我用QE的目的是计算晶体材料的物理化学性能，以及应力对晶体材料的影响，我用最简单的sudo apt-get install 命令下载足够我使用吗？（官网有些区别，但是很多专业名词看不懂，最后也不确定有没有影响我研究的体系）。
另一个问题是，我用sudo apt-get install 命令下载QE后多核计算可以直接使用吗？还是需要另行处理？我电脑上用多核计算的时候出现以下情况，所以我不确定是我电脑硬件设置问题还是没有下载相关软件问题。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-28 09:28
去官网看release note弄清楚后来都更新了什么内容

我始终建议自己编译，编译器能针对当前的CPU进行优化

Quantum ESPRESSO在Linux中的安装方法
http://sobereva.com/562（http://bbs.keinsci.com/thread-18600-1-1.html）

问这种问题必须说清楚当前的运行环境。貌似你是虚拟机，说清楚客户机给了多少核

作者
Author: ChemG 时间: 2021-9-28 16:26
用社长的博文百分百能够成功编译，无论是哪个版本的QE，不过gcc版本较低可能6.6之后的版本编译会出问题。如果想用intel编译器的话也可以参考http://bbs.keinsci.com/thread-1324-1-1.html

作者
Author: snljty 时间: 2021-9-28 16:56
看2楼卢老师链接的第6小节，如果Ubuntu的apt这里和CentOS的结果类似，那你装的是只能单核运行的版本。

作者
Author: ZZG 时间: 2021-9-28 21:55

sobereva 发表于 2021-9-28 09:28
去官网看release note弄清楚后来都更新了什么内容

我始终建议自己编译，编译器能针对当前的CPU进行优化
...

我想在服务器上安装QE，怕出错就在虚拟机上试试。请问下，我之前安装的话，在安装的话需要下载清理之前的版本吗？需要的话怎样彻底清除不影响后面的安装呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-28 22:08

ZZG 发表于 2021-9-28 21:55
我想在服务器上安装QE，怕出错就在虚拟机上试试。请问下，我之前安装的话，在安装的话需要下载清理之前的 ...

我不用Ubuntu，你搜搜Ubuntu上怎么卸载包

作者
Author: ZZG 时间: 2021-9-29 08:33

sobereva 发表于 2021-9-28 22:08
我不用Ubuntu，你搜搜Ubuntu上怎么卸载包

那么在服务器上安装QE不能多核运行，之前安装的会影响接下来的安装吗？谢谢大佬

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-29 10:11

ZZG 发表于 2021-9-29 08:33
那么在服务器上安装QE不能多核运行，之前安装的会影响接下来的安装吗？谢谢大佬

所以让你先把包卸载了

作者
Author: ZZG 时间: 2021-9-29 21:04
本帖最后由 ZZG 于 2021-9-29 21:10 编辑

sobereva 发表于 2021-9-28 09:28
去官网看release note弄清楚后来都更新了什么内容

我始终建议自己编译，编译器能针对当前的CPU进行优化
...

您好，我试着您这个方法，中间出现并行环境未被检测到，这是什么原因呢？内容如下：Parallel environment not detected \(is this a parallel machine?\).\
Configured for compilation of serial executables.

作者
Author: renzhogn424 时间: 2021-9-29 22:24

ZZG 发表于 2021-9-29 21:04
您好，我试着您这个方法，中间出现并行环境未被检测到，这是什么原因呢？内容如下：Parallel environment ...

没装 openmpi，去安装一下

作者
Author: ZZG 时间: 2021-10-1 10:47

renzhogn424 发表于 2021-9-29 22:24
没装 openmpi，去安装一下

嗯嗯解决了，是之前的版本不兼容，谢谢

作者
Author: ZZG 时间: 2021-10-1 10:48

ChemG 发表于 2021-9-28 16:26
用社长的博文百分百能够成功编译，无论是哪个版本的QE，不过gcc版本较低可能6.6之后的版本编译会出问题。如 ...

嗯嗯谢谢，服务器之前版本很低，不兼容，现在处理好了

作者
Author: ZZG 时间: 2021-10-1 10:48

snljty 发表于 2021-9-28 16:56
看2楼卢老师链接的第6小节，如果Ubuntu的apt这里和CentOS的结果类似，那你装的是只能单核运行的版本。

嗯呢，谢谢

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