计算化学公社

标题: VMD里面键的显示、原子颜色更改？ [打印本页]

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-9-29 16:48
标题: VMD里面键的显示、原子颜色更改？
老师，有两个问题。1.我在VMD里面通过Dynamic Bonds来显示键，可以手动删掉一些吗？我试了不行。2.我的团簇里面有P和Pd原子，它们显示的颜色都是一样的，我需要将他们设置为不同的颜色。我也看了卢老师回复其他人的帖子，但是我在Graphics→Colors→Element→Color DefinItions,选完颜色之后也没反应，是最后还需要点击哪里吗？希望老师能为我解答一下这个困惑！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-9-29 16:56
1 没法单独删

2 注意看里面每个字
(, 下载次数 Times of downloads: 47)

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-10-2 21:37
非常谢谢老师耐心指导，已成功修改原子颜色！

作者
Author: 虎王 时间: 2022-5-28 17:37

sobereva 发表于 2021-9-29 16:56
1 没法单独删

2 注意看里面每个字

VMD里哪一种绘制分子骨架的方式可以接受单独对键和原子设不同颜色？

作者
Author: 七尺贱 时间: 2022-5-28 21:32

虎王发表于 2022-5-28 17:37
VMD里哪一种绘制分子骨架的方式可以接受单独对键和原子设不同颜色？

我觉得你如果想做个示意图，可以将你想要重点强调的原子在gview中自行更换成别的原子，然后再转成xyz格式，用VMD绘图

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-29 01:22

虎王发表于 2022-5-28 17:37
VMD里哪一种绘制分子骨架的方式可以接受单独对键和原子设不同颜色？

哪种drawing method都没法单独设
想单独设可以对相应部分创建单独的rep并设置着色方式

作者
Author: 灰飞的旋律 时间: 2025-3-26 14:43

sobereva 发表于 2021-9-29 16:56
1 没法单独删

2 注意看里面每个字

http://sobereva.com/652 请问社长，我想对静电势图里的原子用GVIEW的着色方案，这个方法是不是不行呀，我一把color method改成element，静电势的surface颜色也变了

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-3-26 14:53
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-3-26 14:54 编辑

灰飞的旋律发表于 2025-3-26 14:43
http://sobereva.com/652 请问社长，我想对静电势图里的原子用GVIEW的着色方案，这个方法是不是不行呀， ...

看我这帖对元素着色和等值面着色使用相同编号颜色导致冲突的解释。

作者
Author: 灰飞的旋律 时间: 2025-3-26 15:51

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-3-26 14:53
看我这帖对元素着色和等值面着色使用相同编号颜色导致冲突的解释。

谢谢

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