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标题: 请问大家用什么软件构建二硫键突变 [打印本页]

作者
Author: azero 时间: 2021-10-4 16:22
标题: 请问大家用什么软件构建二硫键突变
一直都是用D S构建二硫键进行突变的，准备写文章但没有版权，想问哪些免费软件可以？modller 同源建模的话会把整个蛋白氨基酸的坐标也会优化，因为只用于静态模拟，所以希望不要优化整个蛋白氨基酸

作者
Author: sobereva 时间: 2021-10-7 22:49
我不晓得你说的突变具体指怎么突变
如果就是对初始结构替换残基，没必要刻意对程序进行引用，本身也有很多程序都可以实现，诸如WHAT IF服务器、pdb fixer等

作者
Author: greatzdk 时间: 2021-10-8 08:52
感觉pymol, free maestro很多应该都是可以的。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-10-8 15:04
DS建模本来也是免费的啊，保存成pdb用Gromacs退火跑平衡提取提取结构再优化一下也不是啥难事

作者
Author: azero 时间: 2021-10-9 09:18

喵星大佬发表于 2021-10-8 15:04
DS建模本来也是免费的啊，保存成pdb用Gromacs退火跑平衡提取提取结构再优化一下也不是啥难事

这样子么。我还以为免费的DS就只能做个图

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-10-9 10:11

azero 发表于 2021-10-9 09:18
这样子么。我还以为免费的DS就只能做个图

不用服务器端就能做的功能都是免费的

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