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标题: 初始原子坐标文件没有添加电荷对模拟氢键结果的影响 [打印本页]

作者
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ZZU_SCU    时间: 2021-10-5 22:19
标题: 初始原子坐标文件没有添加电荷对模拟氢键结果的影响
讲氢键时,静电项正确就可以描述氢键。想问一下如果初始原子坐标文件中没有输入电荷对结果影响很大么?其他项都输入正确了。不输入的话,在优化过程中电荷都是0么?静电项也是0。

我想分析聚合物中的氢键作用。我使用的OPLS力场,用的lammps。我认为分子动力学模拟在某些基础方面是相通的,所以投的综合交流。


作者
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sobereva    时间: 2021-10-5 22:46
我不用lammps,如果程序没自动分配电荷的话就没法描述氢键
作者
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ZZU_SCU    时间: 2021-10-5 23:53
sobereva 发表于 2021-10-5 22:46
我不用lammps,如果程序没自动分配电荷的话就没法描述氢键

好的,谢谢卢老师的解答




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