计算化学公社

标题: 分子半径求助 [打印本页]

作者
Author: 大王雷 时间: 2021-10-8 22:16
标题: 分子半径求助
请问各位老师，我想算这个分子的分子半径，看了sob老师的博文，可利用球形模型或计算长宽高的方法来算，拿不住我这个分子应该用什么模型来计算 (, 下载次数 Times of downloads: 19)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-10-8 23:26
这取决于你计算的目的（算出来的半径用来做什么用），不是单单由分子结构就可以决定用哪种计算方法的

作者
Author: 大王雷 时间: 2021-10-9 10:36

wzkchem5 发表于 2021-10-8 23:26
这取决于你计算的目的（算出来的半径用来做什么用），不是单单由分子结构就可以决定用哪种计算方法的

想根据算出分子的尺寸，来设计载体的孔径大小，达到装载该分子的目的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-10-9 15:40

大王雷发表于 2021-10-9 03:36
想根据算出分子的尺寸，来设计载体的孔径大小，达到装载该分子的目的

载体的孔是球形？圆柱形？长方体？还是其他的形状？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-10-9 16:34

大王雷发表于 2021-10-9 10:36
想根据算出分子的尺寸，来设计载体的孔径大小，达到装载该分子的目的

应当考虑动力学直径，孔径最短方向至少不比这小
使用Multiwfn计算分子的动力学直径
http://sobereva.com/503（http://bbs.keinsci.com/thread-14264-1-1.html）

也注意考虑长宽高
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴
http://sobereva.com/426（http://bbs.keinsci.com/thread-10226-1-1.html）

作者
Author: 大王雷 时间: 2021-10-10 14:10

sobereva 发表于 2021-10-9 16:34
应当考虑动力学直径，孔径最短方向至少不比这小
使用Multiwfn计算分子的动力学直径
http://sobereva.co ...

好的，谢谢老师

作者
Author: btm 时间: 2023-4-13 21:37

wzkchem5 发表于 2021-10-8 23:26
这取决于你计算的目的（算出来的半径用来做什么用），不是单单由分子结构就可以决定用哪种计算方法的

老师，计算SET能垒，所使用的半径该选哪种计算方式啊

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-13 21:46

btm 发表于 2023-4-13 14:37
老师，计算SET能垒，所使用的半径该选哪种计算方式啊

我见过的都是用球形模型，但我不确定这是不是唯一正确的做法

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