计算化学公社

标题: Gromacs/PLUMED 联用实现特定位置浓度差恒定的非平衡分子动力学模拟请教 [打印本页]

作者
Author: 芝士栗子小甜饼 时间: 2021-10-10 09:17
标题: Gromacs/PLUMED 联用实现特定位置浓度差恒定的非平衡分子动力学模拟请教
各位老师好，我在一篇文献上看到它使用PLUMED插件实现了特定位置浓度差恒定的非平衡分子动力学模拟，通读了一遍PLUMED的manual但可能还是没有搞懂这个功能到底怎么用。请教一下各位老师，浓度差恒定的实现是与PLUMED中哪个功能挂钩的呢？

作者
Author: Seymour 时间: 2021-11-2 16:27
你好，请问你知道怎样实现浓度差恒定了吗？

作者
Author: 芝士栗子小甜饼 时间: 2021-11-3 19:45

Seymour 发表于 2021-11-2 16:27
你好，请问你知道怎样实现浓度差恒定了吗？

我并没有找到gromacs怎样实现这个功能，但是lammps实现这个功能还蛮简单的。

作者
Author: Seymour 时间: 2021-11-4 08:48

芝士栗子小甜饼发表于 2021-11-3 19:45
我并没有找到gromacs怎样实现这个功能，但是lammps实现这个功能还蛮简单的。

好的，谢谢你啦。我去学习一下lammps

作者
Author: 筛石灰 时间: 2025-3-27 23:38

芝士栗子小甜饼发表于 2021-11-3 19:45
我并没有找到gromacs怎样实现这个功能，但是lammps实现这个功能还蛮简单的。

请问在lammps上如何实现呀

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)