计算化学公社

标题: gamess 内存不足 [打印本页]

作者
Author:
mozilla88    时间: 2016-1-16 11:03
标题: gamess 内存不足
本人刚刚接触GAMESS计算,遇到一个关于内存不足的问题,请教高手。谢谢先。
我计算的是一个小的团簇(共15个原子:13个Au,2个Cd),用的是网上找的LANL2DZ ECP势。按说这么小的体系,不应该需要太多的内存,但是计算运却给出下面的错误:
***** ERROR: MEMORY REQUEST EXCEEDS AVAILABLE MEMORY
PROCESS NO.    0 WORDS REQUIRED=   1066731 AVAILABLE=   1000000

我试着在$SYSTEM中加入MEMDDI=2000000,程序又提示我,没有权利改变机器的内存。
GAMESS 版本:5 DEC 2014 (R1)
希望得到高手的指点。
下面是我的inp文件:

$CONTRL SCFTYP=UHF RUNTYP=OPTIMIZE PP=READ
ICHARG= 1 MULT=1 DFTTYP=B3LYP MAXIT=200 $END
$SYSTEM TIMLIM=60 $END
$STATPT NSTEP=500 OPTTOL=1.0d-6  $END
$GUESS  GUESS=HUCKEL $END
$BASIS basnam(1)=aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,aubs,
                  aubs,cdbs,cdbs $end
$DATA
DFT geometry optimization
C1
Au  79.0   0.000000   0.000000   0.000000
Au  79.0   1.419860  -2.294120   0.514980
Au  79.0  -1.419850   2.294120  -0.514980
Au  79.0  -0.095180  -1.952200  -1.921100
Au  79.0   0.095180   1.952200   1.921090
Au  79.0   2.282270  -0.345800  -1.450620
Au  79.0  -2.282260   0.345800   1.450610
Au  79.0  -2.383420  -0.309530  -1.450210
Au  79.0   2.383430   0.309540   1.450210
Au  79.0  -0.051710   0.906160  -2.627790
Au  79.0   0.051710  -0.906150   2.627780
Au  79.0  -1.531320  -2.257770   0.570180
Au  79.0   1.531320   2.257770  -0.570190
Cd  48.0   2.759040  -3.699830  -2.328810
Cd  48.0  -2.759030   3.699830   2.328800
$END
$aubs
S   3
  1      2.8090000             -1.2021556        
  2      1.5950000              1.6741578        
  3      0.5327000              0.3526593        
S   4
  1      2.8090000              1.1608481        
  2      1.5950000             -1.8642846        
  3      0.5327000             -1.0356230        
  4      0.2826000              1.3064399        
S   1
  1      0.0598000              1.0000000        
P   3
  1      3.6840000             -0.2802681        
  2      1.6660000              0.7818398        
  3      0.5989000              0.4804776        
P   2
  1      0.6838000             -0.0952078        
  2      0.0977000              1.0299147        
P   1
  1      0.0279000              1.0000000        
D   2
  1      1.2870000              0.5844273        
  2      0.4335000              0.5298161        
D   1
  1      0.1396000              1.0000000   

$end
$cdbs
S   2
  1      0.5095000             -1.2713002        
  2      0.1924000              1.8002112        
S   1
  1      0.0544000              1.0000000        
P   2
  1      0.8270000             -0.1083020        
  2      0.1287000              1.0367049        
P   1
  1      0.0405000              1.0000000        
D   3
  1      5.1480000              0.0703071        
  2      1.9660000              0.5138427        
  3      0.7360000              0.5416758        
D   1
  1      0.2479000              1.0000000

$end
$ECP
  AU-ECP GEN     60     4
  5      ----- g-ul potential     -----
    -60.0000000        1    622.6287956        
   -555.5292312        2    136.2843607        
   -168.0019785        2     33.1549781        
    -63.0399875        2      9.9894895        
     -4.2516681        2      3.0481312        
  6      ----- s-ul potential     -----
      3.0000000        0    194.7374304        
     38.6020880        1    351.5327447        
    864.8370727        2    122.3270402        
    374.9935520        2     32.0914617        
    289.7910100        2      5.2451812        
   -152.4532773        2      4.4916223        
  4      ----- p-ul potential     -----
      2.0000000        0    420.6158801        
     73.8885625        1    109.4417815        
    326.6729872        2     34.1714280        
    126.5814591        2      5.9879750        
  5      ----- d-ul potential     -----
      3.0000000        0    219.2666158        
     55.6793149        1    122.7297786        
    449.1987335        2     63.1063369        
    215.0269091        2     18.3684520        
     64.0840995        2      4.4972844        
  5      ----- f-ul potential     -----
      4.0000000        0    108.5506037        
     51.8065335        1     56.4795527        
    231.2183113        2     29.2069159        
    119.0047386        2      9.5440543        
     15.3424188        2      2.8965118
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  AU-ECP
  CD-ECP GEN     36     3
  7      ----- f-ul potential     -----
     -0.0613214        0    350.0762490        
    -24.9355593        1     81.1757778        
    -87.7728765        2     24.7747818        
    -19.0665030        2     12.5760330        
    -16.1901254        2      4.9889712        
     -3.9441254        2      1.8449910        
     -0.3097476        2      0.5309494        
  5      ----- s-ul potential     -----
      2.9050102        0     54.5786193        
     39.6289198        1     16.0082316        
     57.4435790        2      5.2767462        
     90.2351166        2      0.9731070        
    -71.7139236        2      0.9305646        
  4      ----- p-ul potential     -----
      1.9585463        0     41.3581766        
     37.5669844        1     12.1214982        
     44.0875104        2      3.4478806        
     12.5678599        2      0.9362175        
  6      ----- d-ul potential     -----
      2.9753499        0     85.3710499        
     24.7054373        1     73.0500781        
    218.2163143        2     28.4262887        
    118.9945370        2      3.9450158        
    -82.4999671        2      3.5349379        
     -0.2413758        2      0.6482194   
  CD-ECP
$END
作者
Author:
root    时间: 2016-1-16 13:47
默认只有1MWords即8兆内存。
MWORDS和MEMDDI的单位是1MW,你如果写2000000就是声明16TB的内存。。。
作者
Author:
sobereva    时间: 2016-1-16 22:34
DFT计算不需要设MEMDDI,对后HF计算才需要
你应当设的是$SYSTEM里的MWORDS,MWORDS=x代表在每个节点上用x*8MB内存

PS:这种问题用Gaussian省事得多速度也更快

作者
Author:
mozilla88    时间: 2016-1-18 12:04
非常感谢两位的解释,按sobereva的建议,在$SYSTEM中使用了MWORDS解决了问题。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3