计算化学公社

标题: 如何用VMD使结构中形成的氢键显示出来? [打印本页]

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深爱小李    时间: 2021-10-13 14:20
标题: 如何用VMD使结构中形成的氢键显示出来?
导入由MS动力学模拟后转置过来的xyz格式的文件后,该怎么操作才能显示出结构中形成的氢键呢?
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snljty    时间: 2021-10-13 14:28
主菜单Graphics->Representations
点Create Rep
Drawing Method选HBonds,自己调一下右下角的识别标准和粗细等。
在论坛里随便搜VMD 显示 氢键就有。
作者
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深爱小李    时间: 2021-10-13 14:37
snljty 发表于 2021-10-13 14:28
主菜单Graphics->Representations
点Create Rep
Drawing Method选HBonds,自己调一下右下角的识别标准和 ...

谢谢你的回复,我试过这样,但是只显示了氢键,我的药物结构不显示了,该怎么办呢
作者
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chema    时间: 2021-10-13 16:45
深爱小李 发表于 2021-10-13 14:37
谢谢你的回复,我试过这样,但是只显示了氢键,我的药物结构不显示了,该怎么办呢

没点Create Rep吧
作者
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深爱小李    时间: 2021-10-13 19:33
snljty 发表于 2021-10-13 14:28
主菜单Graphics->Representations
点Create Rep
Drawing Method选HBonds,自己调一下右下角的识别标准和 ...

谢谢你,解决啦
作者
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深爱小李    时间: 2021-10-13 19:34
chema 发表于 2021-10-13 16:45
没点Create Rep吧

确实是的,谢谢你




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