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标题: 一些静电势问题 [打印本页]

作者
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lianghua飘    时间: 2016-1-16 17:35
标题: 一些静电势问题
请教:
1.用Multiwfn算了负离子K2I2-体系的静电势,最小值:-102.74kcal/mol,最大值:11982.7kcal/mol,这个差距非常大,是否合理呢?
2.结合VMD作静电势图时,用这个最大值和最小值作为Color Scale Data Range的数值,等值面图显示的都是同一个颜色,体现不出来变化,这是什么原因呢?
3.Gview作静电势图,色彩的刻度范围的单位是什么,怎么选呢?
多谢!


作者
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sobereva    时间: 2016-1-16 22:48
1 你把你的输入文件发上来我重复一下。最大值不可能那么大,除非是计算整个体系而非分子表面上的最大值。

2 先把1解决了再考虑这个

3 a.u.。同样也是让不同区域静电势的差异最好地反映出来为目的来选择
作者
Author:
lianghua飘    时间: 2016-1-17 15:36
sobereva 发表于 2016-1-16 22:48
1 你把你的输入文件发上来我重复一下。最大值不可能那么大,除非是计算整个体系而非分子表面上的最大值。
...

多谢Sob,附件是我传的K2I2-.fch文件,请您试试,谢谢。

作者
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sobereva    时间: 2016-1-18 00:30
lianghua飘 发表于 2016-1-17 15:36
多谢Sob,附件是我传的K2I2-.fch文件,请您试试,谢谢。


这是因为你对I用了赝势,所以在I的内核区域有电子密度的空洞,因此电子密度0.001等值面也会出现在I的内核区域,这个位置静电势会非常正。
你用全电子基组就行了,或者直接无视掉在内核附近的极大点,也就是忽略掉图中22、24号极大点

(, 下载次数 Times of downloads: 42)

作者
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lianghua飘    时间: 2016-1-18 10:23
sobereva 发表于 2016-1-18 00:30
这是因为你对I用了赝势,所以在I的内核区域有电子密度的空洞,因此电子密度0.001等值面也会出现在I的内 ...

多谢Sob




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