计算化学公社

标题: gmx_MMPBSA 找不到变量 ndpopt 的报错 [打印本页]

作者
Author: 冬至112 时间: 2021-10-15 21:22
标题: gmx_MMPBSA 找不到变量 ndpopt 的报错
在用 gmx_MMPBSA 计算 gromacs 跑的一段轨迹的 pbsa 时，配体有较多正电，想用non-linear pb 算，结果报错：“
InputError: Unknown variable npbopt in &pb
  Enter `gmx_MMPBSA --help` for help
InputError: Unknown variable npbopt in &pb
  Enter `gmx_MMPBSA --help` for help
InputError: Unknown variable npbopt in &pb
  Enter `gmx_MMPBSA --help` for help
”
输入文件：
&general
sys_name="MT_nonlinePB_inp2",
interval=10,netcdf=1,
forcefields="oldff/leaprc.ff99SB",leaprc.gaff"
/
&pb
istrng=0.15, fillratio=4.0,
inp=2,radiopt=0,npbopt=1
/
&decomp
idecomp=2, dec_verbose=2,
print_res="within 6"
/

但是gmx_MMPBSA官网有说明：
不知道这个参数该咋用

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)