计算化学公社

标题: 请问有什么软件或方法可以基于RDF曲线计算PMF曲线 [打印本页]

作者
Author: ydeyun 时间: 2021-10-16 17:27
标题: 请问有什么软件或方法可以基于RDF曲线计算PMF曲线
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大家好，我看文献中基于RDF曲线计算出了PMF曲线，体系是氯化物熔盐体系，请问有没有什么软件或者方法能够基于RDF曲线来求PMF曲线呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-10-16 18:50
手算都能算出来

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作者
Author: waitingseven 时间: 2021-10-16 22:27
能提供一下文献的链接吗？谢谢~~

作者
Author: k64_cc 时间: 2021-10-17 09:36

waitingseven 发表于 2021-10-16 22:27
能提供一下文献的链接吗？谢谢~~

教材上都有

作者
Author: fhh2626 时间: 2021-10-17 14:35
你画的黄线后面不就写着公式吗

作者
Author: ydeyun 时间: 2021-10-17 16:59

waitingseven 发表于 2021-10-16 22:27
能提供一下文献的链接吗？谢谢~~

https://doi.org/10.1016/j.molliq.2020.115262

作者
Author: waitingseven 时间: 2021-10-17 19:48

ydeyun 发表于 2021-10-17 16:59
https://doi.org/10.1016/j.molliq.2020.115262

多谢了

作者
Author: Jasmine123 时间: 2025-1-6 15:58

sobereva 发表于 2021-10-16 18:50
手算都能算出来

老师请问如果通过VMD计算出的径向分布函数有出现纵坐标等于0的部分，是不是无法采用这种方法计算

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-7 01:18

Jasmine123 发表于 2025-1-6 15:58
老师请问如果通过VMD计算出的径向分布函数有出现纵坐标等于0的部分，是不是无法采用这种方法计算

拿具体图像、体系说事
就算没这个情况，也不代表就适合靠rdf转成PMF说明问题，不是什么情况都能用这种做法讨论

作者
Author: Jasmine123 时间: 2025-1-7 21:18

sobereva 发表于 2025-1-7 01:18
拿具体图像、体系说事
就算没这个情况，也不代表就适合靠rdf转成PMF说明问题，不是什么情况都能用这种做 ...

C:\Users\Administrator\Desktop 老师我的模拟体系是钒电解液，这是钒离子与水分子之间的径向分布函数，与文献对照后确定RDF是正确的，所以想利用kirkwood公式计算PMF，不知道是否适合

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-8 03:16

Jasmine123 发表于 2025-1-7 21:18
老师我的模拟体系是钒电解液，这是钒离子与水分子之间的径向分布函数，与文献对照后确定RDF是正确的，所 ...

可以

作者
Author: Jasmine123 时间: 2025-1-8 09:49

sobereva 发表于 2025-1-8 03:16
可以

根据公式G=-KB*T*ln（g(r)),在我的图中2.5-3.5A范围内，g(r)取值是0，也就是说G接近无穷，这种情况应该怎么处理呢

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-9 03:14

Jasmine123 发表于 2025-1-8 09:49
根据公式G=-KB*T*ln（g(r)),在我的图中2.5-3.5A范围内，g(r)取值是0，也就是说G接近无穷，这种情况应该怎 ...

先根据体系结构特征弄清楚为什么那个部分rdf精确为0、为什么在那个距离附近参考组和计算组的粒子间没有出现概率，之后再说PMF的事

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