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标题: 集群编译cp2k,elpa库报错 [打印本页]

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zhou9527    时间: 2021-10-20 23:48
标题: 集群编译cp2k,elpa库报错
各位老师、同学大家好,最近在集群编译cp2k-7.1, 集群没有联网。其他的库都还勉强能编译过去,但是对于elpa库,一直提示install_elpa.sh 103行错误。通过仔细的查看make.log 发现,编译一开始就提示找不到所谓的dependencies.mk文件,但是事实上这个文件事存在的。所以很疑惑到底是为什么。而且我也将相应的路径添加到bash了,发现也是一样。用了很多个elpa脚本,发现都是这个问题。所以,不知道有没有内行的老师、同学能够帮忙解答一下呢?十分感谢,附图是报错信息。 (, 下载次数 Times of downloads: 22)

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sobereva    时间: 2021-10-21 00:20
甭用ELPA就完了
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flyingchow    时间: 2021-10-21 00:40
你还是参照这个帖子
http://bbs.keinsci.com/thread-25773-1-1.html

用singularity打包,然后直接再cluster上使用,应该是最好的办法。
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zhou9527    时间: 2021-10-21 08:44
flyingchow 发表于 2021-10-21 00:40
你还是参照这个帖子
用singularity打包,然后直接再cluster上使用,应该是最好的办法。

好的,十分感谢!
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zhou9527    时间: 2021-10-21 08:44
sobereva 发表于 2021-10-21 00:20
甭用ELPA就完了

嗯嗯,只能这样了,谢谢sob老师
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abin    时间: 2021-10-21 09:02
flyingchow 发表于 2021-10-21 00:40
你还是参照这个帖子
用singularity打包,然后直接再cluster上使用,应该是最好的办法。

很多低智商的管理员,
拒绝安装这个东西的。

然后,意味着,你依旧无法使用。

因为控制不好的话,的确可以逃脱调度器管控。
作者
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zhou9527    时间: 2021-10-21 10:11
abin 发表于 2021-10-21 09:02
很多低智商的管理员,
拒绝安装这个东西的。

老师,您好!按照您这个方法,那我可以在本地做好镜像,直接copy到集群上直接安装吗,因为不能集群联网,所以我每次都是把对应的版本的安装包提前下载好的。然后就是我刚装好7.1,这个还没完全弄好,没精力研究8.2版本,所以不知道这个8.2版本的安装会不会更加的省事儿一点。不过要是设计到yum库,dnf库必须升级这些问题的话,那就难办了
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abin    时间: 2021-10-21 11:00
zhou9527 发表于 2021-10-21 10:11
老师,您好!按照您这个方法,那我可以在本地做好镜像,直接copy到集群上直接安装吗,因为不能集群联网, ...

集群如果没有安装singularity ,
你就不用折腾这个方案了。
除非你能搞定管理员,
让他全集群都安装singularity 。

另,如果你的机器能联网,
又能访问集群。
我有方案可以让你在集群上获取网络。
不用修改网络,也无需root授权。
不过,该方案本身比买路由器要贵的。
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zhou9527    时间: 2021-10-21 11:01
abin 发表于 2021-10-21 11:00
集群如果没有安装singularity ,
你就不用折腾这个方案了。
除非你能搞定管理员,

哦哦,我懂了,谢谢老师




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