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标题: Tinker 在进行minimization以及equilibration时的错误 [打印本页]

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Author: zhutroy 时间: 2021-10-22 11:28
标题: Tinker 在进行minimization以及equilibration时的错误
最近使用Tinker软件对蛋白体系进行极化力场的计算。因为资料教程有限，上手遇到一些问题请教大家，膜蛋白结构体系由charmm-gui直接生成，最小化以及预平衡文件也由charmm-gui提供1.最小化设置为2000步，最后显示LBFGS: Incomplete convergence due to Iterlimit, 是否意味着步长不够，RMS没有达到设定的精度0.01
2.在equilibration过程中，添加了RATTLE以及RATTLE WATER的限制，计算报错RATTLE -- Warning, Distance Constraints not Satisfied
TINKER is Unable to Continue; Terminating the Current Calculation注释掉这个约束条件后重新计算，模拟却没有输出，实在是不解如何解决
望各位指点迷境，谢谢！

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