计算化学公社

标题: 求助使用天河服务器跑vasp模拟总是被killed [打印本页]

作者
Author: wei97zheng 时间: 2021-10-25 10:01
标题: 求助使用天河服务器跑vasp模拟总是被killed
之前用vasp在跑Ce离子的钇铝石榴石晶体（80个原子）模拟，但自己的模拟机跑不动。
就借用了师姐的账号在天河上跑，slurm给出的报告如下图所示。
之前用自己的模拟机跑的时候，在etc里更改了ulimit -s unlimited，我怀疑是这个问题。
现在服务器没有权限修改etc，我在bashrc里添加了
ulimit -s unlimited
ulimit -m unlimited
ulimit -d unlimited

但好像没有效果。
使用的kpoints也给在下面了。
有没有熟悉的大佬可以告诉我怎么让他跑起来啊。
sh文件如下：
#!/bin/sh
yhrun -N1 -n28 -p TH_LONG vasp_std < INCAR KPOINTS POSCAR POTCAR

作者
Author: wei97zheng 时间: 2021-10-25 10:04
本帖最后由 wei97zheng 于 2021-10-25 10:05 编辑

再给出我的incar
SYSTEM

ISTART = 1
ICHARG = 11
LWAVE = .T.
LCHARG = .T.

ENCUT = 600
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.2
EDIFF = 1E-4
NELM = 200

VOSKOWN = 1
LREAL = .F.
PREC = Normal
ALGO = V

EDIFFG = -0.05
IBRION = -1
POTIM = 0.5
NSW = 0
ISIF = 2

LDAU = .TRUE. #(打开+U设置，控制计算中是否考虑在位库伦较正相)
LDAUTYPE = 2 #(+U的类型，1/2/4；2为默认值，U值由LDAUU减去LDAUJ确定)
LDAUL = -1 3 -1 -1 # (控制具体轨道上加U；-1：不加U；1-p轨道；2-d轨道；3-f轨道)
LDAUU = 0 7 0 0 #(O不加U,Ce的f轨道上+U，U值取5)
LDAUJ = 0 0.7 0 0
LMAXMIX = 6

LORBIT = 10
EMIN = -30
EMAX = 30
NEDOS = 2000

作者
Author: abin 时间: 2021-10-25 11:51
天河用的是修改后的slurm，
也就是自主知识产权的调度系统。

错误信息是，cannot allocate memory ，
你有没有申请内存量？
如果没有申请，会默认内存不足的。

有了调度系统，还在bashrc做资源配置，
犹如牙疼医脚后跟。

另，商用平台，为何不叫技术支持？

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