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标题: WSL2下使用ABCluster结合xTB进行搜索进行搜索提示'std::__ios_failure'错误 [打印本页]

作者
Author: AaronO_o 时间: 2021-10-28 16:09
标题: WSL2下使用ABCluster结合xTB进行搜索进行搜索提示'std::__ios_failure'错误
在Win10的WSL2的Ubuntu 20.04中，尝试使用ABCluster结合xTB进行构象搜索。
ABCluster2.0安装过程遵循Manual，并以添加环境变量；xTB同样成功安装并可以稳定运行。

使用ABCluster时，使用isomer以及lego构建原子/分子团簇时均失败。输入和输出如下：

isomer输入文件：
cu4o4       # Result file name
Cu 4 O 4    # Cluster file name
cube 4 3 3 # Structure types
10       # Maximal number of calculations
>>>>
cp $inp$ $xxx$.xyz
xtb $xxx$.xyz --opt > $xxx$.out
cp xtbopt.coord $out$
>>>>

isomer输出文件：
===== (@ o @) =====Error occurs: Commands should terminate by ">>>>".
Error termination at Thu Oct 28 14:08:41 2021.
Total run time: 0 seconds = 0 days 0 hours 0 minutes 0 seconds.

lego输入文件（暂且忽略.cluster和相应结构文件）：
EtNENA-AP
cluster
cube 3 4 3
100
>>>>
cp $inp$ $xxx$.xyz
xtb $xxx$.xyz --gfn 1  --chrg 0 --uhf 0 --opt tight > $xxx$.out
cp xtbopt.coord $out$
>>>>

lego输出文件：
-- Input/Output Parameters --
Input file name:    abc.inp
Cluster file name:    cluster
Result file directory: EtNENA-AP-LM

terminate called after throwing an instance of 'std::__ios_failure'
  what():  basic_filebuf::underflow error reading the file: Is a directory

===== (@ o @) =====
Error occurs: Recieve signal: SIGABRT: Termination by abort call (Value: 6).
Error termination at Thu Oct 28 14:28:33 2021.
Total run time: 0 seconds = 0 days 0 hours 0 minutes 0 seconds.

恳请各位老师能够指出问题所在。

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