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标题: 求助:请问如何用gromacs得到氢键自相关函数 [打印本页]

作者
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邱美佳    时间: 2021-10-28 18:26
标题: 求助:请问如何用gromacs得到氢键自相关函数
请问如何用gromacs计算氢键自相关函数C(t)呢?我得到了hblife.xvg这个数据,不知道出现的两条曲线p(t)和tp(t)分别是什么含义。这个和C(t)有关系吗?

作者
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sobereva    时间: 2021-10-29 06:19
p(t):从0时刻开始能一直持续到t的氢键的概率
t p(t):p(t)与t的乘积
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邱美佳    时间: 2021-10-29 10:28
sobereva 发表于 2021-10-29 06:19
p(t):从0时刻开始能一直持续到t的氢键的概率
t p(t):p(t)与t的乘积

请问卢老师这个p(t)和C(t)含义是一样的吗?C(t)也是体现氢键能维持t时间的概率




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