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标题: 求助：用gromacs统计水分子的键角分布结果很奇怪 [打印本页]

作者
Author: 邱美佳 时间: 2021-11-1 16:41
标题: 求助：用gromacs统计水分子的键角分布结果很奇怪
我用gmx angle统计水分子的键角分布，可是出来的结果都是30多度，这个数值是怎么来的呢？水分子的键角不是应该是104度左右吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-1 17:06
肯定是你的统计方式不对
而且平时用的水模型都是刚性水模型，H-O-H键角是水模型定义的特定的值，严格不变，因此统计H-O-H键角没意义。
如果你说的是氢键键角，那是另外一码事。

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