计算化学公社

标题: Crest为形成的构想轨迹优化的运作问题 [打印本页]

作者
Author: flyingchow 时间: 2021-11-4 04:37
标题: Crest为形成的构想轨迹优化的运作问题
各位老师，我正在用molclus作构象搜索，体系比较大，想用Crest并行作优化节省时间。
我按照Sob老师的教程用./crest -mdopt traj.xyz -gfn0 -opt normal -niceprint > isomers.out在cluster上来批量优化，
但跑了几个小时之后，isomers.out文件啥也没有输出。请问这种情况正常吗？
我自己看xtb的手册，发现crest有一个命令 --T 用来设定线程的，作这个优化的工作需要加这个--T的命令吗？
如果这样的情况不是异常，那怎么才能查询crest优化的进度呢？一直没有文件输出。
谢谢。

作者
Author: exity 时间: 2021-11-4 06:54
如果用ssh登录的话，用nohup来跑可以在nohup.out文件里看到运行记录。

作者
Author: flyingchow 时间: 2021-11-4 07:38

exity 发表于 2021-11-4 06:54
如果用ssh登录的话，用nohup来跑可以在nohup.out文件里看到运行记录。

超算可以用slurm上交作业的。但是完全没有输出啊。

作者
Author: lilf 时间: 2021-11-4 08:51
top命令看看几个线程运行

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)