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标题: 关于cp2k 8.2 psmp 安装 [打印本页]

作者
Author: haisenburg 时间: 2021-11-8 14:31
标题: 关于cp2k 8.2 psmp 安装
本帖最后由 haisenburg 于 2021-11-8 14:37 编辑

经过多天的尝试，终于安装完成了cp2k 8.2，简单总结如下：

1. 关于性能：

经过相同体系测试（220个原子，dft+U，ot算法），相比cp2k7.1 （相同体系，相同算法，相同节点（28核）），cp2k 8.2 要快 35%以上（scf 自洽每一步的时间：cp2k 7.1 是 4.8s， cp2k 8.2  是 3.1s）
结果截图如下：

8.2版结果
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7.1版结果
(, 下载次数 Times of downloads: 11)

2 关于编译器
本人测试了（1） intel 19.1.1 + gcc 9.3.0  ，intelmpi+mkl；（2）intel 19.1.3 + gcc 9.3.0， intelmpi+mkl；（3）intel 19.1.3+gcc9.3.0； openmpi + openblas
测试结果如下：

2.1 三种编译均可顺利完成，且make后进行test，测试全部通过；

2.2 无论是 intelmpi  还是  openmpi，运行速度相同，上述体系测试scf一步均是3.1s，不存在网上说的intelmpi比openmpi快的情况（但openmpi 搭配mkl  本人没有测过，其速度怎样，不得而知）！

2.3  但是用intelmpi  有一个小问题和一个大问题：

2.3.1  小问题是：无论是intel 19.1.1 还是 19.1.3，  quip无法编译（这个毕竟是力场模块，第一性原理计算不需要），因此无关紧要！
2.3.2  大问题是：  无论是intel 19.1.1还是 19.1.3，进行大体系计算时（如上面我的测试体系220个原子），内存不断增加，在大约几个小时后（我测试测aimd，在200步左右），节点内存被吃光（我的节点配置是128G内存），由于没有内存可用，程序终止！！！  这个问题会导致无法计算，而且程序终止后，没有任何错误提示！！！！！

3.3 上述3中编译，均存在一个小问题

elpa，sirius 均无法编译通过（intelmpi的话，再多一个quip无法通过），由于epla 据说仅仅影响一点对角化速度，Sirius 是基于纯平面波的（涉及此计算，可用vasp或QE），因此不影响cp2k的使用，因为cp2k的优势就是基于gpw，大体系，速度快！！！！

附上使用的 toolchain 编译方法：

1.  安装intel 19.1.3（即 parallel_studio_xe_2020_update4_cluster_edition）

2. 安装gcc 9.3.0

3. toolchain安装

3.1 openmpi+openblas（推荐）
nohup ./install_cp2k_toolchain.sh --no-check-certificate --install-all --mpi-mode=openmpi --math-mode=openblas --with-openmpi=install --with-gcc=system --with-openblas=install --with-scalapack=install --with-elpa=no --with-libvdwxc=no --with-sirius=no > setup.log 2>&1 &

3.2 intelmpi+mkl (内存逐渐增大是个致命问题，关键速度并没有优势，不推荐)
nohup ./install_cp2k_toolchain.sh --no-check-certificate --install-all --mpi-mode=intelmpi --math-mode=mkl --with-intelmpi=system --with-mkl=system --with-gcc=system --with-elpa=no --with-quip=no --with-libvdwxc=no --with-sirius=no --with-spla=no > setup.log 2>&1 &

4. 补充说明，不要用 intel 新出的 oneAPI，这个坑我踩过了，无论是哪个版本，我最后make时候，均报错！！！
后来看下官网的 compiler 推荐如下：
(, 下载次数 Times of downloads: 12)

明确说了 oneAPI  是 unsupported！！！（但是好像2021.3 并没有 classic版本？？？？，这个有点搞不懂了）
我装的是psmp版，ssmp没有测试！
我的系统是cetos 7.6

欢迎大家讨论！！！

作者
Author: abin 时间: 2021-11-8 14:49
【CP2K v8.2.0 MPI并行版安装无需root授权-哔哩哔哩】https://b23.tv/RJ4ifm

有空的话，对比测试一下这个版本。
看看计算效率差多少？

作者
Author: haisenburg 时间: 2021-11-8 23:01
报错啊

(, 下载次数 Times of downloads: 24)

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